手動在Python中繪製樹狀圖

我已經實現了一種算法來解決圖中的聚類問題。我使用python庫「python-graph」來表示圖形。現在，在我的計算的每一步（該算法是迭代的），我必須繪製樹狀圖的一部分。事實上，該算法是分裂的，從原始圖開始計算聚類。現在，我不知道用什麼來繪製樹狀圖（有人建議PIL，但我正在尋找一些簡單的東西，我不知道如何使用PIL）...你能提出一些建議並告訴我如何做陰謀嗎？手動在Python中繪製樹狀圖

注：我讀了其他問題，但似乎一切都使用方法，使用羣集的自動計算...這不是我要找的：我需要手動繪製樹狀圖或至少找到一種方法表示要繪製的集羣。

謝謝！

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2011-06-26 Raffo

實施scipy dendrogram的代碼可以找到here，這個簡單的implementation將幫助您繼續前進。

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2011-06-26 14:04:46 eat

一些例子這是一個很難找到一種方法，它的很多代碼看，我仍然無法弄清楚如何畫樹狀圖，而產生這......這不是在不知道最終結果的情況下輕鬆定義圖像大小。我認爲更好的解決方案是創建樹，以某種方式表示並找到一個函數來繪製它。看到這裏：http://stackoverflow.com/questions/5957625/how-can-i-create-a-dendrogram-in-r-using-pre-clustered-data-created-elsewhere – Raffo

@Raffo：你檢查詳細方式https://gist.github.com/846567？恕我直言，這是非常簡單的，你應該很容易能夠從中提取你真正需要的東西。謝謝 – eat

我必須在代碼中挖一點點，我沒有注意到它。我剛纔看到幾乎沒有任何意見.. – Raffo

或許是其他的解決方案可能是這一個： http://ete.cgenomics.org/ 我建議你主要幫助PDF開始： http://ete.cgenomics.org/releases/ete2/doc/ete_tutorial.pdf

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2011-06-26 17:40:34 fransua

這似乎是一個非常強大的庫，謝謝。 – Raffo

的ETE蟒蛇工具給你畫樹很多的可能性。繪圖引擎允許編程樹渲染。樹可以被繪製爲PNG或SVG圖像。樹狀圖可以表示爲矩形或圓形髮束。

儘管ETE通常用於處理系統發生樹，但它還提供了一個聚類模塊，並具有多種特殊的預定義可視化模式。

檢查在http://packages.python.org/ete2/tutorial/tutorial_drawing.html

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2011-12-13 14:53:51 jhc

手動在Python中繪製樹狀圖

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