將Pandas Dataframe轉換爲RCV

我有一個數據幀表示一個協方差矩陣s.th.這樣將Pandas Dataframe轉換爲RCV

names = ['AA','BB','CC','DD','EE'] 
x_ = np.random.normal(size=5) 
y_ = np.random.normal(size=5) 
z = np.vstack((x_, y_)) 
cov_mat = np.cov(z.T) 
cov_mat = np.triu(cov_mat, k=0) 
cov_mat_df = pd.DataFrame(cov_mat) 
cov_mat_df.index = names 
cov_mat_df.columns = names

導致

  AA  BB  CC  DD  EE 
AA 0.271191 -1.064020 -0.311409 0.834741 -0.464261 
BB 0.000000 4.174687 1.221814 -3.275110 1.821531 
CC 0.000000 0.000000 0.357591 -0.958533 0.533111 
DD 0.000000 0.000000 0.000000 2.569378 -1.429021 
EE 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.794784

我想這個保存爲CSV，而放棄對內存大小的原因全部0的格式如下

Idx1 Idx2 Value 
    AA  AA 0.271191 
    AA  BB -1.064020 
    AA  CC -0.311409 
    ...  ... .... 
    DD  EE -1.429021 
    EE  EE 0.794784

我嘗試使用熊貓旋轉功能，但我認爲我需要相反的。

來源

2017-09-04 ThatQuantDude

使用stack替換爲0到NaN，所以這行被丟棄：

df = df.replace(0,np.nan).stack().rename_axis(('idx1','idx2')).reset_index(name='Value') 
print (df) 
    idx1 idx2  Value 
0 AA AA 0.271191 
1 AA BB -1.064020 
2 AA CC -0.311409 
3 AA DD 0.834741 
4 AA EE -0.464261 
5 BB BB 4.174687 
6 BB CC 1.221814 
7 BB DD -3.275110 
8 BB EE 1.821531 
9 CC CC 0.357591 
10 CC DD -0.958533 
11 CC EE 0.533111 
12 DD DD 2.569378 
13 DD EE -1.429021 
14 EE EE 0.794784

來源

2017-09-04 14:45:12 jezrael

完美的感謝，任何想法，我怎麼能夠無視0爲好，我用np.triu只得到的上半矩陣 – ThatQuantDude

將Pandas Dataframe轉換爲RCV

回答

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