2015-08-16 129 views
0

glmmPQL對於多個隨機效果的語法是什麼?R:GLMM glmer vs glmmPQL

隨着glmer我的代碼如下所示:

fit<- glmer(A~B+C+ (1 | D)+ (1 | E), family = gaussian, data=data) 

如何重寫使用glmmPQL同樣的事情?

我嘗試:

fit<- glmmPQL(A~B+C, random=c (~1 | D, ~1 | E), family = gaussian, data=data) 

,但它給出了一個錯誤。

glmerglmmPQL之間的主要區別是什麼?

回答

1

基於你提供的示例中,與glmmPQL的模型將被指定爲:

fit <- glmmPQL(A ~ B + C, random = list(D = ~1, E = ~1), family = gaussian, data = data) 

AFAIK,glmer之間的主要區別和glmmPQL(其依賴於功能(這是由包lme4提供) lme,來自nlme pacakge)是nlme中使用的參數估計算法未針對處理交叉隨機效應而優化,所述交叉隨機效應與稀疏設計矩陣相關聯,而lme4利用了該結構;參見,例如,皮涅羅&貝茨, 「混合效應在S和S-PLUS模型」,斯普林格,2000,第163上lmer/glmerlme之間的差異的進一步的引用是通常的:

https://stats.stackexchange.com/questions/64226/lme-and-lmer-comparison https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2006-October/115572.html

相關問題