使用Matplotlib改變圖形中的顏色來繪製熊貓數據框

所以我有一個數據框，我用下面的代碼繪製並看起來很棒。問題是，在數據框中有多達10種顏色被使用和重複用於多個輸入，所以不可能將一個數據幀條目與另外20個數據條目區分開來。使用Matplotlib改變圖形中的顏色來繪製熊貓數據框

我覺得必須有一些方法來說明'使用X顏色方案，並允許60種顏色'，但我不知道如何使用數據框時。

dataframe = pd.DataFrame(new_vals) 
dataframe.plot(kind='bar',stacked=True,legend=False, ylim=(0,100),title='Taxonomic analysis of samples') 

N = 29 
ind = np.arange(N) 
width = 0.35 




plt.xlabel('Sample') 
plt.ylabel('Percentage of assembly atrribted to each taxonomic group (%)') 
plt.legend(loc="best", bbox_to_anchor=(1.0, 1.00)) 
plt.xticks(ind+width/2. - 0.2,('B11', 'B2', 'B3', 'B4', 'B5', 'B6', 'B7', 'B8', 'B9', 'C10', 'C11', 'C2', 'C3', 'C4', 'C5', 'C6', 'C7', 'C8', 'C9', 'D10', 'D11', 'D2', 'D3', 'D4', 'D5', 'D6', 'D7', 'D8', 'D9'))

這是我的數據框的一個例子;

Other actinomyces alcanivorax alkaliphilus bacillus bacteroides candidatus phytoplasma cyanothece enterobacter escherichia ... neisseria paenibacillus porphyromonas prevotella pseudoalteromonas rothia staphylococcus streptococcus streptomyces veillonella 
0 26.229808 5.198240 4.694513 0.047974 3.691476 0.792203 2.782495 2.018697 2.180294 0.453228 ... 1.677198 4.944483 0.458910 5.496815 2.910004 0.372430 0.599676 8.276785 1.992817 0.595257 
1 24.395006 11.615767 1.995668 0.069200 5.750399 0.921047 1.248692 0.740260 0.967860 1.904479 ... 0.873587 1.316648 0.261579 4.954371 1.348089 2.405995 1.061885 18.200302 1.660959 5.382657 
2 22.078940 5.772762 3.107776 0.070983 5.523827 1.428608 1.846615 1.218850 1.542251 1.656823 ... 0.986514 2.414715 0.617899 6.893698 2.014352 0.496304 1.056452 22.272679 1.470803 2.696270 
3 33.438669 5.210649 0.043170 0.136277 7.108181 2.148167 0.071589 0.034340 0.073281 2.719497 ... 1.922939 0.111153 3.898990 6.426144 0.045960 4.365727 1.545480 17.170125 0.870670 3.480261 
4 20.831026 3.001972 4.746576 0.034374 2.198009 0.677926 3.264413 2.524014 2.720162 0.563074 ... 1.167616 9.110402 0.358742 3.323339 3.180934 0.420669 0.408120 8.948355 1.856454 1.086865

來源

2015-10-13 Tom

IIUC可以產生k顏色的顏色表中包含的功能如下：

def colormapgenerator(N, cm=None): 

    base = plt.cm.get_cmap(cm) 
    color_list = base(np.linspace(0, 1, N)) 
    cm_name = base.name + str(N) 
    return base.from_list(cm_name, color_list, N)

其中cm是您的desidered cmap（如Blues，Reds等），以及N是多少你需要的顏色。比嘗試添加到您的dataframe.plot()以下內容：

cmap=colormapgenerator(60, 'Reds')

希望有所幫助。

來源

2015-10-13 13:05:53

使用Matplotlib改變圖形中的顏色來繪製熊貓數據框

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