假設我有2個CSV文件:比較在蟒蛇不同的CSV文件
文件1:
Epitope Name,Epitope,Protein,position,position
3606,NSRSTSLSV,FOO,10,21
文件2:
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K
0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,NSRSTSLSV
從本質上講,我想看看內容文件1中的行1在文件2的第10行中找到。如果內容匹配,我將打印第3個csv,該文件是文件1的新版本,並且列中有找到或未找到。
現在,我沒有找到一切,我知道不是這樣。在某些情況下,從第一個文件中的文本可能文本的較大塊裏面發現從文件2.
這裏是我到目前爲止(改編自更早找到了答案):
#usr/bin/python2.4
import csv
f1 = file ('all_epitopes.csv', 'rb')
f2 = file ('positiveBcell.csv', 'rb')
f3 = file ('results.csv', 'w')
c1 = csv.reader((f1), delimiter=",", quotechar='"')
c2 = csv.reader((f2), delimiter=",", quotechar='"')
c3 = csv.writer((f3), delimiter=",", quotechar='"')
positiveBcell = [row for row in c2]
for all_epitopes_row in c1:
row = 1
found = False
for master_row in positiveBcell:
results_row = all_epitopes_row
if all_epitopes_row[2] == positiveBcell[10]:
results_row.append('FOUND in Bcell List (row ' + str(row) + ')')
found = True
break
row = row +1
if not found:
results_row.append('NOT FOUND in Bcell list')
c3.writerow(results_row)
f1.close()
f2.close()
f3.close()
只是好奇,有沒有你做// positiveBcell = C2中一行行]的理由//你這麼做的時候//爲C1 all_epitopes_row://爲C1?此外,如果我有權訪問您的csv文件,它將有助於更輕鬆地調試代碼(至少對我來說)。 – sihrc