未找到SGE命令，未定義變量

Question

我正在嘗試設置新的計算羣集，並且在SGE中使用qsub命令時當前遇到錯誤。這裏有一個簡單的實驗說明了什麼問題：

test.sh

#!/usr/bin/zsh 

test="hello" 
echo "${test}" 

test.sh.eXX

測試=你好：命令未找到。

測試：未定義的變量。

test.sh.oXX

警告：未獲得TTY（不良的文件描述符）。

因此在這個shell中沒有作業控制。

如果我在頭節點（sh test.sh）上運行腳本，輸出是正確的。我通過輸入「qsub test.sh」將作業提交給SGE。

如果我在像HPC這樣的已建立的計算羣集上以相同的方式提交完全相同的腳本作業，它可以按預期完美工作。什麼設置可能導致這個問題？

感謝您對此事的任何幫助。

Answer 1

很可能您的羣集上的隊列被設置爲posix_compliant模式，其默認shell爲/ bin/csh。 posix_compliant設置意味着你的＃！行被忽略。您可以將隊列更改爲unix_behavior或使用qsub的-S選項指定所需的shell。

#$ -S /bin/sh