.pbbs文件中的天真並行化

Question

是否可以在PBS文件中跨for循環執行並行化？

下面是我的attempt.pbs文件。我想分配4個節點並同時爲每個節點分配16個進程。我已經成功完成了這項工作，但現在我有4個工作，我想向每個節點發送一份工作。 （我需要這樣做，因爲排隊算法中都會讓我等待幾天的時間，我使用的羣集上提交4個獨立的工作）

#!/bin/bash 
#PBS -q normal 
#PBS -l nodes=4:ppn=16:native 
#PBS -l walltime=10:00:00 
#PBS -N HuMiBi000 
#PBS -o HuMiBi.000.out 
#PBS -e HuMiBi.000.err 
#PBS -A csd399 
#PBS -m abe 
#PBS -V 

./job1.sh 
./job2.sh 
./job3.sh 
./job4.sh 

的工作獨立運行，並且不使用相同的數據。我可以從同一個pbs腳本爲每個節點運行1個作業嗎？

謝謝。

Answer 1

達到此目的的標準方法是通過消息傳遞接口（MPI）庫。打開MPI是您可以使用的良好實現。一些基本的例子可以在here找到，如果你想了解更多信息，這是OpenMPI的tutorial。