如何創建多行的箱線圖？

我有1200個探針（行中）的數據框和兩組數組，每組九列。前九欄命名爲「正面」，後九欄命名爲「負面」。我想通過使用盒圖選擇12個隨機探針來表明表達正常。我的代碼如下：如何創建多行的箱線圖？

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
for(i in seq(from=1, to=1200, by=10)){ 
    boxplot(probes[i]~f,col="lightblue",main="Expression of genes studied Cells") 
}

但我收到以下錯誤：

Error in model.frame.default(formula = probes[i] ~ f) : 
    variable lengths differ (found for 'f')

如果我用箱形圖的正常工作一個探頭。我得到兩個箱子，一個對應於「積極的」，另一個爲「負面」：

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
genex<-as.numeric(dat.fp.labeled["NM_139321.1_psr1_at",]) 
boxplot(genex~f,col="lightblue",main="Expression of NM_139321.1_psr1_at samples")

來源

2013-08-17 user2649495

你能提供關於結構的更多細節你的數據？探測器是一個矢量嗎？如果沒有，那麼你在調用'boxplot'時會錯誤地編制索引。此外，您當前的代碼將創建120個箱型圖，但我不認爲這就是您想要做的... – Thomas

可能重複[按兩個條件分組的多個箱型]（http://stackoverflow.com/questions/13124827/多箱線形 - 按兩條件分組） – Metrics

它是一個數據幀，包含1200行和18列.18列有兩種類型。前9名被命名爲「正面」，後9名被命名爲「負面」。如果我爲單排而言，它可以很好地生成兩個框，每個框用於正面和負面。代碼：是：f <-c（rep（「positive」，9），rep（「negative」，9）） genex <-as.numeric（dat.fp.labeled [「NM_139321.1_psr1_at」，]）boxplot（genex〜f，col =「lightblue」，main =「NM_139321.1_psr1_at樣本的表達式」） – user2649495

此，我認爲，這是你想要什麼：

set.seed(1) 
probes <- data.frame(matrix(rnorm(1200*18),ncol=18)) 
f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
myrows <- sample(1:1200,12,FALSE) 
boxplot(unlist(probes[myrows[1],])~f) # first plot 
for(i in myrows){ 
    boxplot(unlist(probes[i,])~f) 
    Sys.sleep(1) # wait for each plot for 1 sec 
}

來源

2013-08-17 13:05:00 Thomas

嗨托馬斯，感謝您的示例代碼。我有一個問題：我會在哪裏放置我的數據？在您的代碼中，您正在創建數據框，探針。讓我們說我的數據在名爲data.fp的數據框中，我可以在哪裏放入代碼？謝謝 – user2649495

在for循環中，它表示「unlist（probes [i，]）''。如果你把它改成'unlist（data.fp [i，]）'，我想你應該得到預期的結果。 – Thomas

如何創建多行的箱線圖？

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