獲取FactoMineR包中提供的eta2表

Question

我正在使用FactoMineR在生物數據集上執行PCA，其中每列都是一個基因，並且這些行包含不同的樣本。樣本屬於不同的組別（對照/治療;癌症/非癌症）。在應用PCA（）函數時，我已經將這些信息作爲定性補充，並且我理解當我們調用$ quali.sup $ eta2時，會得到一個表格，其中每個分類變量與主要組件之間的平方相關。我的問題是：這張桌子怎麼樣完全失去了 - 相關性是如何精確計算的？

Answer 1

（平方）是樣品（在FactoMineR術語個體）的座標之間計算和分類變量表示爲數字因子水平的相關性。

Answer 2

p41的包vingette標識爲eta2作爲相關係數。

相關係數是基於相關的相關矩陣。

確切的方法應該在軟件包作者提供的參考範圍內。產生特徵值和特徵向量的方法通常是包不同的地方，但矩陣代數通常是相同的。

Husson，F.，Le，S.and Pages，J.（2010）。探索性多變量分析通過實例使用R， 查普曼和霍爾。