MCA在FactoMineR

Question

我畫使用FactoMine R.我有一個像這樣的數據表一個MCA情節：

Met Aa  Fn  Pg  Pi  Tf  Smut Ssob An  Csput 
C1 High N.S. N.S. N.S. High N.S. High High N.S. 
C2 High N.S. Low  High N.S. N.S. N.S. N.S. N.S. 
C4 High High N.S. High N.S. N.S. High N.S. High 
C6 N.S. N.S. High N.S. N.S. N.S. N.S. N.S. High 
C9 Low  Low  Low  Low  Low  High N.S. Low  Low 
C12 N.S. N.S. Low  N.S. N.S. N.S. High N.S. High 

###So I loaded my data 
metabolites<-read.csv2('MCA24h_carbon.csv',dec='.')##all metabolites at 24h 

###Named the column 
metID<-metabolites$met 

###Created a new matrix 
newmet<-subset(metabolites,select=-c(Met)) 

### and the number of categories per variable 
cats<- apply (newmet, 2, function(x) nlevels(as.factor(x))) 


#and this is the output I get from the analysis: 
structure(c(85L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 1L, 
3L, 3L, 3L, 3L), .Names = c("Var", "Aa", "Fn", "Pg", "Pi", "Tf", 
"Smut", "Ssob", "An", "Csput")) 

這是我的第一個紅色的牌子......後來，我執行馬華只是爲了看看我會得到，這是代碼：

mca1=MCA(metabolites, graph=FALSE) 
mca1$eig 
mca1$var$coord 
mca1$ind$coord 
mca1_var_df=data.frame(mca1$var$coord, Variable=rep(names(cats), cats)) 
mca1_obs_df= data.frame(mca1$ind$coord) 

接着，我會在控制檯以下：

Error in data.frame(mca1$var$coord, Variable = rep(names(cats), cats)) : 
    arguments imply differing number of rows: 269, 254 

我很新，使用R （在1周內），但我有使用SAS的經驗...我不知道我在做什麼錯誤，爲什麼R將數據修復到上述結構（3L，3L，3L ...）有沒有人有任何想法如何進行？

Answer 1

我遇到了同樣的問題，我通過刪除NA的 來修復它，並檢查您的係數級別是否與該因子的標籤數量相同！