2017-08-10 87 views
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我正在嘗試使用圖形工具繪製具有彩色頂點的網絡圖。我正在嘗試繪製下面顯示的here以下的graphML文件。圖形工具GraphML支持彩色頂點?

然而,色彩不與下面的代碼顯示:

g = Graph() 
g= load_graph("filename.graphml", fmt="graphml") 
graph_draw(g) 

圖形渲染,但沒有顏色上的頂點,只爲默認的紅色。我認爲graphML完全支持?

圖形工具文檔指出:「唯一能夠完美保留內部屬性圖的文件格式是」gt「和」graphml「,因此,只要有可能,它們應該優先於其他格式。

顏色不是內部屬性嗎?

Oringinally我是在DOT圖形。我有一個索引取決於節點名稱的顏色數組 - 節點是按升序排列的整數。但是,當我使用時:

for v in g.vertices(): 
    v_prop[v] = colourarray[vertex] 

顏色沒有對應正確的節點。這是由於load_graph似乎有自己的想法,哪些節點是哪個索引。有沒有人知道我可以在這裏做什麼?

<graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd"> 
    <key id="d0" for="node" attr.name="color" attr.type="string"> 
    <default>yellow</default> 
    </key> 
    <key id="d1" for="edge" attr.name="weight" attr.type="double"/> 
    <graph id="G" edgedefault="undirected"> 
    <node id="n0"> 
    <data key="d0">green</data> 
    </node> 
    <node id="n1"/> 
    <node id="n2"> 
    <data key="d0">blue</data> 
    </node> 
    <node id="n3"> 
    <data key="d0">red</data> 
    </node> 
    <node id="n4"/> 
    <node id="n5"> 
    <data key="d0">turquoise</data> 
    </node> 
    <edge id="e0" source="n0" target="n2"> 
    <data key="d1">1.0</data> 
    </edge> 
    <edge id="e1" source="n0" target="n1"> 
    <data key="d1">1.0</data> 
    </edge> 
    <edge id="e2" source="n1" target="n3"> 
    <data key="d1">2.0</data> 
    </edge> 
    <edge id="e3" source="n3" target="n2"/> 
    <edge id="e4" source="n2" target="n4"/> 
    <edge id="e5" source="n3" target="n5"/> 
    <edge id="e6" source="n5" target="n4"> 
    <data key="d1">1.1</data> 
    </edge> 
    </graph> 
    </graphml> 

回答

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您正在混合屬性映射的存在與它實際用於繪圖。如果你想使用一個屬性映射,你必須明確這樣做:

graph_draw(g, vertex_fill_color=g.vp.color) 

請看看文檔,其中包含這樣的例子很多。

dot和graphml文件中存在的固有頂點「名稱」作爲內部屬性映射加載。在點的情況下,該屬性映射被命名爲「vertex_name」:

g.vp.vertex_name 
在graphml的情況下

,如果頂點標籤不是規範(即,編號爲0到N-1),它被存儲爲「_graphml_vertex_id」:

g.vp._graphml_vertex_id 
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我仍然不明白如何創建一個屬性映射,並將頂點標識​​爲傳遞給它們的整數。如果我的輸入DOT文件看起來像: 1→3 那麼我必須創建一個屬性名來定義它們的名字嗎?如果迭代器不遵循這個順序,我該如何做到這一點? 你能指點我這些例子嗎? – Gawnie

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@Gawnie我編輯了答案來解決你的問題。 –