0
我有以下兩個矩陣中的甲基化計數數據。如何計算跨樣本的兩個矩陣之間的相關性?
cov <- matrix(sample(0:7, 100,replace=TRUE), nrow=10, ncol=10)
colnames(cov) <- c("group1_1", "group1_2", "group1_3", "group1_4", "group1_5", "group2_1", "group2_2", "group2_3", "group2_4", "group2_5")
meth <- matrix(sample(7:10, 100,replace=TRUE), nrow=10, ncol=10)
colnames(meth) <- c("group1_1", "group1_2", "group1_3", "group1_4", "group1_5", "group2_1", "group2_2", "group2_3", "group2_4", "group2_5")
每個矩陣中前五個樣本屬於group1,後五個樣本屬於group2。
我被要求跨越樣本查看矩陣間的相關性,目的是識別異常值。我如何執行這個測試,我應該尋找什麼?