有非常好的庫來做非負矩陣分解（NMF）嗎？

Question

我有一個稀疏矩陣，其形狀是570000 * 3000。我嘗試nima做NMF（使用默認的nmf方法，並將max_iter設置爲65）。不過，我發現nimfa很慢。有沒有人使用更快的庫來做NMF？

Answer 1

我以前用過libNMF。它用C編寫，速度非常快。有一個paper記錄算法和代碼。

本文還列出了幾種可供選擇的包NMF（在一羣不同的語言（我在這裏複製以備將來參考）的。

• Mathworks公司[3,33]
  • Matlab的
  • http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/stats/nnmf。
• Cemgil [5]
  • Matlab的
  • http://www.cmpe.boun.edu.tr/~cemgil/bnmf
• Cichocki等。 [6]
  • Matlab
  • http://www.bsp.brain.riken.jp/ICALAB/nmflab。
• Cichocki et al。 [7]
  • Matlab的
  • http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0470746661.html
• Hansen等人。 [14]
  • Matlab的
  • http://isp.imm.dtu.dk/toolbox/nmf/index.html
• 霍爾[16]
  • Matlab的
  • http://www.cs.helsinki.fi/u/phoyer/software.html
• Kim等人。 [19]
  • Matlab的
  • http://userweb.cs.utexas.edu/users/dmkim/Source/software/nnma/index.html
• 林[25]
  • Matlab的/ Python的
  • http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/nmf/index.html
• Schmidt等人。[30]
  • Matlab的
  • http://mikkelschmidt.dk/index.php?id=2
• Gaujoux [10]
  • ř
  • http://cran.r-project.org/web/packages/NMF/index.html
• 柳[26]
  • ř
  • http://cran.r-project.org/web/packages/NMFN/index.html
• 巴滕貝格等。 2
  • 的Python
  • http://www.eecs.berkeley.edu/~ericb
• Schmitt等人。 [31]
  • 的Python
  • http://www.procoders.net/?p=409
• Dhillon等人。 [8]
  • C++
  • http://www.kyb.mpg.de/bs/people/suvrit/work/progs/nnma.html
• Greene等。 [13]
  • C++
  • http://mlg.ucd.ie/nmf
• 帕塔克等。 [28]
  • C++
  • http://www.insight-journal.org/browse/publication/152
• Wang等人。 [34]
  • C++
  • http://www.biomedcentral.com/1471-2105/7/175

聲明：我還沒有嘗試過任何這些其它的包（除了MATLAB的）。