如何從顯微鏡上拍攝的圖像中分割出細胞，沿着Matlab中完成的操作？在Python中進行細胞分割和熒光計數
http://blogs.mathworks.com/steve/2006/06/02/cell-segmentation/
另外，如果我採取不同的熒光信道的多個圖像（有一些抗體/製造者染色細胞後），我怎樣才能自動定量細胞的陽性每個標記的級分？有沒有人在Python中做過這樣的事情？還是有Python中的庫可以用來做到這一點？
您可以使用OpenCV庫在Python中執行此操作。
特別，你會感興趣的以下特點：
cv.EqualizeHist）。這是來自當前Python API的missing，但是如果您下載OpenCV的最新SVN版本，則可以使用它。這部分是唯一的，並不需要得到同樣的結果cv.Watershed - 它exists，但由於某種原因，我在手冊中找不到它）考慮到這一點，這是我會怎麼用OpenCV中得到相同的結果MATLAB文章：
cv.FindContoursimextendedmax操作做）我還沒有嘗試過任何（對不起，現在沒有時間），所以我不能告訴你任何代碼。然而，根據我對OpenCV的經驗，我相信到第7步的所有內容都可以正常工作。我以前從未使用過OpenCV的分水嶺轉換，但我無法看到它不能在此工作的原因。
嘗試執行我已經顯示的步驟，並讓我們知道您是否有任何問題。一定要張貼您的來源，讓更多的人能夠幫助您。
最後，要回答您關於染色細胞並量化其存在的問題，知道您正在使用的染料是相當容易的。例如，要確定用紅色染料染色的細胞，您需要從圖像中提取紅色通道並檢查高強度區域（可能是通過閾值）。
雖然這個鏈接可能回答這個問題，但最好在這裏包含答案的基本部分，並提供參考鏈接。如果鏈接頁面更改，則僅鏈接答案可能會失效。 – 2015-06-06 21:42:29
@AndrewSvetlov感謝哥們...... 4年前你在哪裏告訴我們這件事。 – so12311 2015-06-07 01:13:19
而只是爲了增加一個：cellprofiler.org（開源的細胞圖像分析軟件，在python）
不知道如何把這個放下抱，但試圖編輯解決（而挑剔的和不正確的）「關主題「標記。 – 2015-06-09 22:22:31
@bluefeet - 爲什麼關閉？這是一個具體問題，下面有兩個具體答案。我編輯了要求推薦的部分。 – 2015-07-12 04:32:26
@thouis這是爲什麼關閉？因爲這個問題太廣泛了，而且還要求一個圖書館。您的編輯刪除最後一行基本上無效每個答案就這個問題，只是指向一個鏈接。關閉一個問題並不意味着它會被刪除，但是這個寫的問題是無關緊要的。 – Taryn 2015-07-13 14:48:07