細胞分割

Question

我是計算機視覺的新手。我的目標是區分一組圖像上的單個單元格，如下所示：Example

基本上，我模糊整個圖像，找到它的最大區域，並在離散模糊圖像的距離變換的分水嶺算法中使用它。其實我下面的教程，你可以在這裏找到：

github上/ luispedro/Python的圖像教程

（對不起，不能發佈超過2個鏈接）。

我的問題是，我的一些細胞有非常明顯的黑核（你可以看到這個例子），我的算法產生的結果像this這是錯誤的。

當然可以通過增加高斯模糊的強度來解決它，但它會合並其他一些細胞，甚至更糟。

可以做些什麼來解決這個問題？如果分水嶺不適用於這種情況，還有什麼其他可能性（請記住，我的集合很小，學習看起來不可能）？

Answer 1

如果您不使用帶標記的分水嶺，分水嶺趨向於過分分段。

通常，我們從DNA/DAPI分割開始，它很容易，它提供了分水嶺的細胞數量和內部標記。

如果模糊圖像，則會平滑所有圖案。你應該使用一個替代的順序過濾器（打開/關閉）來簡化每個區域，然後嘗試一個最終的侵蝕，以便找到你的分水嶺內部種子的數量。