Bland-Altman在Python中的陰謀

Question

是否有可能在Python中生成Bland-Altman plot？我似乎無法找到任何關於它的事情。

這種類型的圖的另一個名稱是圖基平均差圖。

例子：

Answer 1

如果我已經明白的情節背後的理論正確，此代碼應提供基本的繪圖，而你可以把它配置到自己的特定需求。

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 

def bland_altman_plot(data1, data2, *args, **kwargs): 
    data1  = np.asarray(data1) 
    data2  = np.asarray(data2) 
    mean  = np.mean([data1, data2], axis=0) 
    diff  = data1 - data2     # Difference between data1 and data2 
    md  = np.mean(diff)     # Mean of the difference 
    sd  = np.std(diff, axis=0)   # Standard deviation of the difference 

    plt.scatter(mean, diff, *args, **kwargs) 
    plt.axhline(md,   color='gray', linestyle='--') 
    plt.axhline(md + 1.96*sd, color='gray', linestyle='--') 
    plt.axhline(md - 1.96*sd, color='gray', linestyle='--') 

在data1和data2的相應的元件被用於計算用於標繪點的座標。

然後，您可以通過運行

from numpy.random import random 

bland_altman_plot(random(10), random(10)) 
plt.title('Bland-Altman Plot') 
plt.show() 

Answer 2

也許我失去了一些東西，但是這似乎很容易：

from numpy.random import random 
import matplotlib.pyplot as plt 

x = random(25) 
y = random(25) 

plt.title("FooBar") 
plt.scatter(x,y) 
plt.axhline(y=0.5,linestyle='--') 
plt.show() 

在這裏，我只是0和1之間我創造一些隨機數據隨機在y = 0.5處放置一條水平線 - 但您可以隨心所欲放置任意位置。