一張圖中的多個ROC曲線ROCR

是否可以使用ROCR軟件包繪製不同分類器的roc曲線？我已經試過：一張圖中的多個ROC曲線ROCR

>plot(perf.neuralNet, colorize=TRUE) 
>lines(perf.randomForest)

，但我得到：

Error en as.double(y) : 
    cannot coerce type 'S4' to vector of type 'double'

謝謝！

來源

2012-12-29 kahlo

與lines -approach的問題是，有沒有，如果包不支持的幾個地塊在一個窗口中，你可以與其他R.路標準儀器解決問題通用S4行功能用於在ROCR包中定義的類performance的對象。但是您可以像使用額外的add = TRUE參數那樣使用通用繪圖功能。例如，這部分是從?plot.performance示例頁面：

library(ROCR) 
data(ROCR.simple) 
pred <- prediction(ROCR.simple$predictions, ROCR.simple$labels) 
pred2 <- prediction(abs(ROCR.simple$predictions + 
         rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1)), 
     ROCR.simple$labels) 
perf <- performance(pred, "tpr", "fpr") 
perf2 <- performance(pred2, "tpr", "fpr") 
plot(perf, colorize = TRUE) 
plot(perf2, add = TRUE, colorize = TRUE)

或者，你可以存儲矩陣中的所有的預測和做一個所有的後續步驟：，

preds <- cbind(p1 = ROCR.simple$predictions, 
       p2 = abs(ROCR.simple$predictions + 
       rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1))) 

pred.mat <- prediction(preds, labels = matrix(ROCR.simple$labels, 
       nrow = length(ROCR.simple$labels), ncol = 2)) 

perf.mat <- performance(pred.mat, "tpr", "fpr") 
plot(perf.mat, colorize = TRUE)

順便說一句，如果你由於某種原因，真的想用lines繪製連續的ROC曲線，你將不得不做某事。像這樣：

plot(perf) 
lines([email protected][[1]], [email protected][[1]], col = 2)

來源

2012-12-29 20:09:42 adibender

優秀！正是我在找什麼！ – kahlo

R具有在一個窗口中繪製幾個圖的功能。 Example of several ROCs 條與此腳本：An example of ROC curves plotting with ROCR

來源

2012-12-29 19:56:05 psyprog

謝謝！唯一的問題是這個解決方案似乎是用於交叉驗證的數據，所以例如添加圖例來區分哪條曲線屬於哪個分類器是不可能的。哪些是在同一個窗口中繪製幾個圖的工具？ – kahlo

您可以使用函數子圖或查看此文檔：[鏈接] http://www.statmethods.net/advgraphs/layout.html – psyprog

呼應@adibender，並添加註釋：該示例不包括如何設置不同的顏色用於使用第二（曲線一次全部）的辦法每個單獨的曲線。在這種情況下，通過col列表：

library(ROCR) 
data(ROCR.hiv) 
x <- prediction(ROCR.hiv$hiv.nn$predictions, ROCR.hiv$hiv.nn$labels) 
ROC <- performance(x, "tpr", "fpr") 
plot(ROC, col = as.list(1:10))

來源

2015-12-30 20:28:28

一張圖中的多個ROC曲線ROCR

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