如何使用信息增益和卡方統計對基因排序完成微陣列數據?請用一個簡單的例子來說明..如何使用信息增益對基因進行排名?
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A
回答
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你可以使用開源機器學習軟件Weka。加載你的數據集並轉到「選擇屬性」選項卡。使用以下屬性評估程序:
ChiSquaredAttributeEval:通過計算關於類的卡方統計量的值來評估屬性的價值。
InfoGainAttributeEval:通過測量關於類的信息增益來評估屬性的價值。
..使用Ranker在「搜索方法」中。這樣的屬性是由他們個人的評估排名
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我完全不明白你的問題,而是一個非常成功的包裝,用於分析微陣列數據可以在這裏找到:
這是一個軟件該項目擁有各種不同的模塊,用於從微陣列中讀取數據並進行統計分析。這是非常有用的,因爲微陣列數據的文件格式隨着技術的發展而不斷變化,並且用於分析微陣列數據的算法也顯着提高。
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您可以使用InfoGainAttributeEval
計算信息增益 和check this answer
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你在考研搜索的更多信息? http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed – Pierre
我不確定這是否是適合此問題的論壇;你會在這裏看到很多程序員,但這是非常特殊的。 –
這應該關閉,因爲沒有編程相關。關於問題領域的問題多於關於編程的問題。 – dsimcha