在IGRAPH

Question

計算相配我有一個數據集如下：

set.seed(123) 
A = data.frame(rnorm(10),rnorm(10),rnorm(10),rnorm(10)) 

，然後用於IGRAPH包進行網絡出了以下內容：

inv<-cor(t(A)) 
inv[inv<0.5] <- 0 
inv[inv==1] <- 0 
g1 <- graph.adjacency(inv, mode = "undirected", diag=FALSE, weighted=TRUE) 

我們計算G1的相配coefficeint ，

assortativity (g1, types1, types2 = NULL, directed = TRUE) 

我現在的問題是，我應該如何設置「types」，它在文檔中說它是ver tex值。究竟是什麼意思？我想計算任何5個頂點網絡的協調性。誰能告訴我這是怎麼完成的？

Answer 1

所以我想你想要的標稱版本的assortativity。例如。

V(g1)$foo <- sample(1:3, replace=TRUE, vcount(g1)) 
assortativity.nominal(g1, types=V(g1)$foo) 
# [1] -0.2270916 

類型必須是從1開始的整數。請參閱文檔中的詳細信息。