blast給定GI NCBI核苷酸數據庫

Question

我有本地數據庫驅動的網站，其中包含幾個序列，通過它們的GI號碼進行唯一標識。直接給予地理標誌，可以鏈接到'NCBI爆炸網站'嗎？例如，對於GI 903049序列有此鏈接：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/903049

它鏈接到這個爆炸頁：

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&QUERY=U22848.1&DATABASE=nr&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&LINK_LOC=nuccore&PAGE_TYPE=BlastSearch

我想鏈接到這個網站，直接，而不必去NCBI。謝謝。

Answer 1

可以使用NCBI efetch下載所有的GIS：

http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=903049&rettype=fasta&retmode=text

和運行爆炸的本地版本：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download

你也可以問映泰：http://www.biostars.org/show/questions/