如何查看某個進程在具有Sun Grid Engine的羣集上使用了多少個節點？

我（試圖）在Sun Grid Engine的多核計算羣集上運行R.我想使用MPI環境和snow/snowfall parLapply（）函數並行運行R.我的代碼至少在我的筆記本電腦上工作，但要確定它是否能夠在集羣上實現它，我有以下問題。如何查看某個進程在具有Sun Grid Engine的羣集上使用了多少個節點？

如果我要求多個插槽/節點，比如4，我如何檢查一個正在運行的進程是否實際使用了所請求的CPU的全部數量？是否有可以顯示有關進程的請求節點上的CPU使用情況的詳細信息？

clusterEvalQ(cl, Sys.info()['nodename'])

這應該與所報告分配的節點列表：

來源

2015-04-01 user3825755

這是[你的框架]（http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/manuals.html）？如果是這樣，也許'qstat'會爲你（'qstat - 顯示Sun Grid Engine作業和隊列的狀態）。 – 2015-04-01 09:03:47

是的，我認爲是。 'qstat'顯示分配的內核/插槽數量的正在運行的作業，但不顯示進程實際使用的運行作業數量 – user3825755 2015-04-01 09:10:40

使用'qstat'，我對此表示懷疑。您可以使用qhost監視每個負載的負載，並嘗試推斷您的進程是否使用了正確數量的CPU，但這也不是理想的。另外，使用'qstat -j '也許你可以推斷使用秒數與實際運行時間的CPU使用率？一般來說，如果您測試代碼並且它在筆記本電腦上並行工作，它應該在GridEngine上並行工作。有什麼讓你懷疑的嗎？ – Vince 2015-04-01 13:08:43

爲了驗證集羣工人真正開始適當的節點上，我經常使用下面的命令創建羣集對象之後qstat命令。

要真正瞭解CPU使用情況，我經常ssh到每個節點並使用像top和ps這樣的命令，但是如果有很多節點需要檢查，這可能會很痛苦。我們在我們的羣集上建立了Ganglia監控系統，因此我可以使用Ganglia的Web界面來檢查各種節點統計信息。您可能想要與您的系統管理員聯繫，看看他們是否設置了任何監控。

來源

2015-04-02 12:28:13

如何查看某個進程在具有Sun Grid Engine的羣集上使用了多少個節點？

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