Corrplot意義

我不知道我應該把像corrplot的代碼method=」spearman」看到sperman相關Corrplot意義

cor.mtest <- function(mat, conf.level = 0.95){ 
mat <- as.matrix(mat) 
n <- ncol(mat) 
p.mat <- lowCI.mat <- uppCI.mat <- matrix(NA, n, n) 
diag(p.mat) <- 0 
diag(lowCI.mat) <- diag(uppCI.mat) <- 1 
for(i in 1:(n-1)){ 
for(j in (i+1):n){ 
tmp <- cor.test(mat[,i], mat[,j], conf.level = conf.level) 
p.mat[i,j] <- p.mat[j,i] <- tmp$p.value 
lowCI.mat[i,j] <- lowCI.mat[j,i] <- tmp$conf.int[1] 
uppCI.mat[i,j] <- uppCI.mat[j,i] <- tmp$conf.int[2] 
} 
} 
return(list(p.mat, lowCI.mat, uppCI.mat)) 
} 
res1 <- cor.mtest(mtcars,0.95)

來源

2014-01-21 user3217374

將'method ='spearman''添加到'cor.mtest'函數中的參數中，以便它成爲默認值（如果需要，用戶可以稍後更改它）。您還需要在'tmp < - cor.test'這行中添加'method = method' – rawr

這不是一個非常有效的實現。但是，主要問題是它不會調整多個測試的p.values。 – Roland

的論點method=」spearman」將被傳遞到cor.test功能的意義：

cor.test(mat[,i], mat[,j], conf.level = conf.level, method = 」spearman」)

有關更多詳細信息，請參閱?cor.test的幫助頁面。

來源

2014-01-21 14:42:14

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