我正在想象一個數據集與heatmap.2
函數從gplots
包在R.基本上我是對原始數據執行分層聚類分析,同時強制熱圖顯示數據的有限版本(-3和+3之間),以限制異常值對熱圖外觀的影響,同時仍保留原始聚類。當我使用完整的數據集(fullmousedatamat
)時,它工作得很好。但是,當我使用部分數據集(partialmousedatamat
),並且想要使用與完整數據集相同的密鑰進行繪圖時,一些顏色會從關鍵字中刪除,我無法弄清楚原因。R gplots heatmap.2 - 關鍵是不穩定的使用中斷參數(警告:未分類的'中斷'將在使用前排序)
這裏是包含相關數據集的要旨和分析:
https://gist.github.com/jeffbruce/7412f567ac57fe1721a3
通知如何在中心白色的任一側上的第四顏色被丟棄了。也許這對我來說就像是一個bug。我收到以下警告消息,我不知道如何解釋:
Warning message:
In image.default(z = matrix(z, ncol = 1), col = col, breaks = tmpbreaks, :
unsorted 'breaks' will be sorted before use
感謝您的幫助!