的R - gplots - 在heatmap.2卸下空格鍵時= FALSE

Question

我有：

library(gplots); 
x<-matrix(seq(1:100),nrow=10,byrow=TRUE); 
heatmap.2(x, Rowv=NA, Colv=NA, scale="none", main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", col=gray((255:0)/255), dendrogram="none",trace="none", key=FALSE); 

當鍵被指定爲FALSE，有白色空間上圖的左側的塊這會阻止完整的標題出現，與手動指定較小的頁邊空白相沖突，並將熱圖向右移動。白色空間的寬度是可控的使用"keysize=#"，但是使它太小（0.8和1.0之間的某處）創建了一個錯誤："Error in plot.new() : figure margins too large"

我會嘗試用heatmap()代替heatmap.2()這樣做，但熱圖無法播放以及我需要一個項目的par()。如果有人有任何建議，我會很感激。

Answer 1

heatmap.2圖的定位元素可以使用佈局參數完成。

layout(mat = lmat, widths = lwid, heights = lhei) 

我得到一個相當可接受的熱圖使用以下內容。

heatmap.2(x, 
    Rowv=NA, 
    Colv=NA, 
    scale="none", 
    main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", 
    col=gray((255:0)/255), 
    dendrogram="none", 
    trace="none", 
    key=FALSE, 
    lmat=rbind(c(2),c(3),c(1),c(4)), 
    lhei=c(1,1,9,0), 
    lwid=c(1) 
    ); 

請參考?layout或this answer on Stack Exchange瞭解更多詳情。