chemistry

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我是醫院教育部門的實習生，我的任務是將達文波特圖變成一個有效的交互工具，以便教師可以在他們的演示中使用它。我在這個水平的化學或方程解決方面沒有背景/知識。達文波特圖題： http://imgur.com/Lo87Aib（沒有足夠的信譽發表圖片）我一直在它的一對夫婦現在日子，用它製成的進展了很多，我用海軍報.js結合jQuery實現幾乎相同的克隆，並具有拖放數據點的功能，還可以使用用戶輸入並更

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從PDB文件

，得到殘餘的性質我有一個PDB文件，我想使用Python來解析PDB，我想找到PDB的殘留物的： 1. hydrophobicity 2. interface topology 3. solvent accessible surface area 我一直在使用pybel嘗試 file_name = "4hhb.pdb" allmols = [mol for mol in pybel.re

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ChemoSpec找不到getManyCsv功能

我試圖創建光譜對象（.RData），就像上建議ChemoSpec.pdf（見下面的代碼），我得到這樣的錯誤消息：「找不到getManyCsv功能」我怎樣才能解決這個問題？任何建議表示讚賞。我有R版本3.1.0和ChemoSpec版本2.0-2。下面是代碼： getManyCsv(gr.crit = c("ICLPS", "PEPS"), gr.cols = c("red3", "dodger

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python與.pdb文件

我正在開發生物項目。我有.pdb（蛋白質數據庫）文件，其中包含有關分子的信息。我想找出一個分子在.pdb文件如下：分子質量 H鍵供體。 H鍵受體。 LogP。折射率。 python中有沒有可以處理.pdb文件的任何模塊？如果不是那麼任何人都可以請讓我知道我該怎麼辦？我發現了一些模塊，如sequtils和protienparam但他們不這樣做。我已經研究過，然後發佈，所以請不要投票。

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將磅轉換爲已知比重的加侖

我正在做液體儲存的終端。我需要寫一個計算器，可以導致一磅和一加侖。對於卡車來說，它們進來的時候稱量液位，當液位變滿時將其稱重，然後重新放回液位。這個比例以磅爲單位。 NET是來自卡車的液體量。兩個問題： Q1）------- 如果液體是2-乙基己醇，怎麼才能把它轉換爲加侖知道：一）45000英鎊產物（淨） b）比重爲0.833（20℃） c）中的每加侖水8.3378重量計算8.3378 *

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DBPedia查詢缺少某些化合物

我在執行此查詢，以獲取來自DBPedia public SPARQL endpoint的所有化合物的列表。 SELECT * WHERE { ?y rdf:type dbpedia-owl:Drug. ?y rdfs:label ?Name . OPTIONAL {?y dbpedia-owl:iupacName ?iupacname} . OPTIONAL

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在Excel中使用VBA宏從NCI中檢索化學結構的圖像化學名稱解析器

基於this site（見下文）給出的代碼，我想調整一些VBA Excel宏以將化學名稱轉換爲Excel中的化學結構在NCI化學標識符解析器在http://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure 特別地，我想延長的代碼有一個額外的功能以返回我的結構，其中該結構的圖像應當從被檢索的圖像（GIF） XMLhttp.Open "GET", "http://cac

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什麼將是一種有效的搜索機制來遍歷200+化學反應庫

我目前正在開發一種有機轉換模擬器，它有助於在提供起始化合物和終止化合物時在轉化的兩個步驟之間生成。我正在尋找一種搜索機制來獲得中間化合物。我已經遇到了蠻力作爲解決方案來搜索。但是因爲我在圖書館裏有200多個反應來檢查每個化合物，我認爲這會導致大量的時間消耗。還有哪些其他技術或算法可以減少耗費時間來高效完成我的需求。例如我有模糊邏輯，遺傳算法等

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R：根據自定義距離函數和多個條件快速匹配記錄

我在R中進行了一些功能，將化學質譜（具有兩列整數質量和強度的矩陣）與基於自定義光譜相似性函數和化合物的所謂保留指數（即洗脫時間）的匹配（例如，參見http://webbook.nist.gov/cgi/cbook.cgi?ID=C630035&Mask=200）。爲此，每個記錄的列表元素「RI」必須與庫中的列表元素進行比較，並且當絕對偏差小於給定容差時，它應該將最佳譜庫匹配添加到我的記錄中。下面是

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如何製作蟒蛇有機化學復古合成發生器？

我想通過製作一個簡單的程序，生成一個典型的實踐問題，有機化學學生通常面臨考試：復古綜合問題來學習python。對於那些不熟悉這種類型的問題：學生被給予一系列化學反應的初始和最終物種，然後被要求確定對初始反應物進行哪些試劑/反應以獲得最終產物。有時候，你只給最終產品，並要求列出需要合成給出了一些參數的反應（僅開始與具有5個或更少碳化合物只能用酒精等）到目前爲止，我做了一些研究，我認爲RDkit