circos

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我試圖在mac OSX 10.9上安裝libgd（https://mikewest.org/2007/04/installing-libgd-from-source-on-os-x）並在此處找到更多信息（Installing GD library for perl on MacOSX 10.6）。主要目標是能夠安裝和使用Circos。我按照所有安裝各種庫libpgn，主要利用./configu

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Circlize plot - 沒有畫出清晰的線條

我有這個腳本，這導致了這個非常漂亮的circlize情節。 install.packages('circlize', repos = "http://cran.rstudio.com/") install.packages('data.table', repos = "http://cran.rstudio.com/") library(circlize) library(data.tab

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如何創建由另一個文件中的值定義的間隔文件 - 用於WGS數據的圓圈成像

我想用circos軟件描述我的寄生蟲的全基因組序列（WGS）數據。我想描述的一個要素是參考基因組的區域，對此我沒有來自寄生蟲的測序數據。我爲了做到這一點，我已經使用Samtools創建mpileup文件，從我所提取的位置處的序列深度= 0。因此，我有，看起來像這樣一個文件： $chromosome_name $chromosome_position $depth chr_1 1 0 chr

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'circos'風格情節與matplotlib？

有沒有人知道是否有方法使matplotlib python包或任何其他python庫製作circos-style地塊？他們不必像這個例子那樣好看。

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使用CircosJS如何鏈接佈局的div的

我有點新d3js，我試圖用這一個模塊：https://github.com/nicgirault/circosJS 我做什麼我堅持一個plunker：https://plnkr.co/edit/8Sn0quYr5teCv239W9k6?p=preview 我怎樣才能連接他們之間的月份？這裏是我的JS代碼： var myCircos = new Circos({ container: '

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具有精確位置的D3和絃圖

我想創建chord diagram in D3，但要指定間隔與精確位置的關係，如以下示例中的Circos：。有沒有辦法在D3中做到這一點？如果沒有，有沒有辦法做到這一點在任何其他javscript數據可視化庫？

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麻煩安裝字體:: TTF模塊

我未能通過cpan Font::TTF安裝模塊。我在草莓perl 5.24，windows 8 32bit。 C:\Users\user>cpan Loading internal null logger. Install Log::Log4perl for logging messages There seems to be running another CPAN process (p

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你好世界的例子嗎？

有人能爲我提供一個「你好世界」的例子嗎？（www.circos.ca）我知道有大量的壓縮文件提供的教程，但我學習的方式是採用最小配置，然後從中構建 - 而我找不到這個。那麼，有人能幫我嗎？

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如何減少圓環引擎中特定節點之間的邊緣長度graphviz

enter image description here如何減少graphviz圓環引擎中特定節點的邊緣長度。這裏是19個節點和22個邊的簡單點文件。我使用以下命令編譯： circo「input-filename」-Gstart = 5 -Gsize = 1,2！ -Gdpi = 300 -Teps -o「輸出文件名」 digraph graphname { node [fontname =

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在Perl中安裝GD.pm時啓用PNG支持

我已經安裝了GD.pm.我想確保它支持PNG。所以要檢查我是這樣做的： $ perl -e 'use GD; $im=GD::Image->new(); print $im->can("png") ? "yes" : "no" , "\n";' no 如你所見。它打印no。後來我從CPAN用以下步驟下載最新的GD： > wget http://search.cpan.org/CPAN/a