我是一名具有0個計算機技能的生物學家,但我需要一個簡單的腳本將大量DNA序列劃分爲更小的.fasta進行BLAST搜索。我一直瀏覽這個網站幾天,找到一個無濟於事的答案。我幾乎從biopython食譜中複製了我的代碼。爲什麼這不起作用? def batch_iterator(iterator, batch_size):
entry = True # Make sure we loop on
有人能幫助我想出一個策略編輯我的FASTA文件,該文件有下列格式 sp|Q9NYW0|T2R10_HUMAN Taste receptor type 2 member 10 OS=Homo sapiens
sp|Q9NYV9|T2R13_HUMAN Taste receptor type 2 member 13 OS=Homo sapiens
條目對於這些線,我需要將文本「_REVERSED
我有一個fasta文件。我需要刪除含有「N」或不含至少3個獨特鹼基的序列。 目前爲止的代碼如下。另外,我將如何刪除序列ID行,以便刪除序列。 #!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
open FILE, '<', $ARGV[0] or die qq{Failed to open "$ARGV[1]" for input: $!\n};
ope