fasta

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    我很想知道是否有任何生物信息學工具可以處理multiFASTA文件,這些文件可以爲我提供諸如序列號,長度,核苷酸/氨基酸含量等信息,也可以自動繪製描述性圖表。 R生物傳感器解決方案或BioPerl模塊也可以,但我找不到任何東西。 你能幫我嗎?非常感謝:-)

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    我有一個FASTA文件包含幾個蛋白質序列。格式就像 ---------------------- >protein1 MYRALRLLARSRPLVRAPAAALASAPGLGGAAVPSFWPPNAAR MASQNSFRIEYDTFGELKVPNDKYYGAQTVRSTMNFKIGGVTE RMPTPVIKAFGILKRAAAEVNQDYGLDPKIANAIMKAADEVAE GKLN

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    我有興趣從FASTTA格式的BLAST輸出中獲取未去除的序列。我以爲我可以使用hsps_no_gap但它不起作用。有什麼方法可以用來完成這個任務嗎?

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    我有一個fasta文件(第一個序列在下面提到)與長描述。我需要選擇特定的描述字段。當我使用下面的代碼時;整個描述進入字符串。 from Bio import SeqIO for record in SeqIO.parse("geneTemp.fasta", "fasta") : id=record.id desc=record.description print des

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    我需要解析初步GenBank平面文件。該序列尚未發佈,因此我無法通過加入來查找並下載FASTA文件。我是生物信息學的新手,所以有人可以告訴我在哪裏可以找到BioPerl或BioPython腳本來自己做這件事?謝謝!

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    以下是我搜索用戶提供的主題在命令行輸入的FASTA文件的代碼。當我運行它並輸入一個我知道在文件中的圖案時,它會返回'Motif not found'。我只是一個Perl的初學者,我無法理解如何讓它打印出主題,更不用說返回標題了。我希望有任何幫助解決這個問題。 謝謝。 use warnings; use strict; my $motif; my $filename; my @seq;

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    我有fasta格式的序列,其中包含序列開始處的17 bp引物。引物有時會有不匹配。因此,我想刪除序列的前17個字符,除了來自fasta頭文件。 的序列是這樣的: > name_name_number_etc SEQUENCEFOLLOWSHERE > name_number_etc SEQUENCEFOLLOWSHERE > name_name_number_etc SEQUENCEFO