gplots

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我有一個熱圖，想要爲多列創建共享標籤，即列1和列2的標籤以及列3和列4（或列的任意組合）的標籤。這可能與heatmap.2？當前情節：所需的輸出：

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我使用通過R-Studio並想通過heatmap.2繪製heatmap。當通過strCol選項更改列標籤的角度時，我會在輸出PDF文件的heatmap之前打印一條NULL消息。附加最小代碼重現該問題： {r, message=FALSE,warning=FALSE, echo=FALSE} require(gplots) data(mtcars) x <- as.matrix(mtcars

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將heatmap2中的零值保留爲無值

我正在使用gplots和Rcolorbrewer使用heatmap2()函數生成熱圖。我的數據有零，表示此示例中沒有記錄任何數據。要創建熱圖，我希望這些零點被着色爲白色，其餘的點在三色圖例中。這是迄今爲止代碼： my_palette <- colorRampPalette(c("blue", "green", "red"))(n = 299) col_breaks = c(seq(0.001

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ř熱圖：隱藏單元格的值cellnote = 0

我已經如在此示出的工作熱圖，與gplots建成， A AA AAA BBB CASH CASH 0 0 0 0 JSUB 0.22171 0 0 2.20712 SECR 2.92828 1.97112 3.53786 0.91444 SENR 18.86672 11.53339 15.06844 21.57709 SSEN 5.707 1.96225

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在gplot中使用filled.contour在R中添加軸標題R

這是我可重現的代碼示例。除了軸標題/標籤沒有被添加以外，一切看起來都應該如圖所示。儘管遵循了函數文檔中的指導，但我很努力想辦法解決這個問題。幫助將非常感謝 - 事先感謝。 output <- matrix(data = c(0.7,0.5,0.3,0.8,0.6,0.4,0.9,0.7,0.5,1,0.8,0.6),nrow=3, ncol=4) # Change colum

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R：heatmap.2不會產生對稱的情節甚至我設置SYMM = T

我具有相同rownames和colnames矩陣：Matrix 然後我使用heatmap.2對稱地繪製它： heatmap.2(matrix, Rowv=T, scale='none', dendrogram="row", symm =T, col = brewer.pal(9,"Reds")) 但我得到如下圖：它不是對稱的。有人可以給我一個建議嗎？感謝， sessionInfo() R

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如何調整熱圖中的顏色範圍.2

我想繪製使用R語言的熱圖。在繪製熱圖圖後，我發現我的熱圖不適合解釋，因爲顏色鍵的範圍沒有很好地調整。正如您在下面看到的，與我的數據分佈相比，顏色鍵範圍非常長（它們在0到4之間）。因此，熱圖中的所有顏色都是綠色的。如何解決這個問題呢？以下是我的代碼。（我試圖尋找解決方案，但我沒有找到我的情況下適當的線程。） library(gplots) matrix <- as.matrix(read

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如何在層次聚類後提取由gplots創建的熱圖所衍生的矩陣？

我正在製作熱圖，但在繪圖之前我無法將結果分配給變量以檢查結果。 Rstudio自動繪製它。我想按照熱圖的順序得到rownames的列表。我不確定這是否可能。使用此代碼我'： hm <- heatmap.2(assay(vsd)[ topVarGenes, ], scale="row", trace="none", dendrogram="both", col = color

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igraph中的顏色特定節點

我試圖爲節點6和7着色，而不管從對象'd'中選擇的任何字母。 g <- graph_from_literal(1:2:3:4:5 -- 6:7) # Rename (sum up all the vertices) d <- c("a", "b", "c", "d", "e", "f", "g","h", "i", "j") V(g)$name <- sample(d, 7, replac

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如何在R中的heatmap2中將行標籤從右向左移動？

所以我想改變從右到左出現的行標籤。