tidyverse

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我有一個數據框包含約450K甲基化的beta值。 450個探針用於兩個樣品。該數據顯示在三列，看起來像這樣： >head(ICGC) submitted_sample_id probe_id methylation_value 1 X932-01-4D cg00000029 0.6 2 X932-01-6D cg00000029 0.4 3 X932-01-4D cg0

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是否存在與SELECT ... COUNT（*）... GROUP BY ...等價的等價物？

我想了解如何完成「group by」和「count」功能。我看了好幾篇文章，沒有找到我想要的東西;如果有已經發布的答案，我會很感激鏈接。例如，我正在查找數據中的異常值;我想知道哪些地方收到的最「壞」的措施： place = rep(c('AL','AK','AZ','AR','CA','CO','CT','DE','FL','GA','HI'), times=4) measure = rep(

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編程分解數據框中的選定列，整潔的方式？

下面是一個簡單的例子： library(tidyverse) frame <- tribble( ~a, ~b, ~c, 1, 1, 2, 5, 4, 7, 2, 3, 4, 3, 1, 6 ) key <- tribble( ~col, ~name, ~type, ~labels, 1, "a", "f", c("on

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傳播價值從兒童與整潔

我有一棵樹在屬級別註釋（即每個葉子都有一個名字），我想宣傳葉子的顏色在分支/邊緣，只要孩子有相同的屬，像這樣的情節： Source 我的樹是here（對不起，dput不工作...），他看起來就像是： library(ggraph) library(tidygraph) load("tree_v3") TBL %>% activate(nodes) %>% as_tibble # A ti

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one_of（）爲什麼調用它？

爲什麼dplyr::one_of()被稱爲？所有其他select_helpers名稱對我而言是有意義的，所以我想知道是否有我不明白的one_of()方面。我對one_of()的理解是，它只允許您使用名稱的字符向量來選擇變量，而不是將它們的名稱放入select()調用中，但是您可以獲得所有名稱位於向量中的變量，而不僅僅是其中之一他們。那是錯的，如果這是正確的，名字one_of()從哪裏來？

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使用帶有否定選擇傭工如mutate_at（）（未one_of（））

我有一個看起來像這樣的數據： library(dplyr) set.seed(123) df <- data_frame(X1 = rep(LETTERS[1:4], 6), X2 = rep(1:2, 12), ref = sample(1:50, 24), sampl1 = sample(1:50, 24), var2 =

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在嵌套數據幀列上使用mutate_at（）生成多個未發生列

我正在使用dplyr,tidyr和purrr進行實驗。我的數據是這樣的： library(tidyverse) set.seed(123) df <- data_frame(X1 = rep(LETTERS[1:4], 6), X2 = sort(rep(1:6, 4)), ref = sample(1:50, 24), sampl1 = sa

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在pkgdown參考中包含「所有其他函數」yaml

我有一個pkgdown站點，其中我將許多函數分組到參考文件.yml的類別中。我想知道是否有辦法將我沒有明確分類的所有功能放入他們自己的類別中。我唯一的想法是使用matches功能，像這樣： reference: - title: "someCategory" contents: - myFunction - title: "other" contents:

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聯合所有tibble列與tidyr

我想統一所有的列在一個tibble到一個爲以後處理。每當我嘗試這樣做，我得到錯誤錯誤if（！after）c（values，x）else if（after> = lengx）c（x，values）else c（x [1L ：後]：缺少其中TRUE/FALSE所需值的tidyr:unite documentation說，你可以不指定任何列做到這一點這裏的玩具，例如： ex <- as_tibble

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如何使用dplyr突變兩個數據幀的條件

我有兩個數據幀，它們基於第三個更大的數據集。我想根據第二個數據框中的條目來標準化一個數據幀中的數據 - 我最喜歡使用dplyr，但其他包/解決方案也非常感謝:) 在我的第一個數據框中，我有不同器官的數量。數據幀organ_count # A tibble: 5 x 2 organs count <fctr> <int> 1 Organ_A 23