的Python 3.5想要繪製PCA與sklearn和matplotlib

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使用下面的代碼生成錯誤：類型錯誤：浮置（）參數必須是一個字符串或數字，而不是「強的鬆」：的Python 3.5想要繪製PCA與sklearn和matplotlib

我竭力要弄清楚是什麼導致這個錯誤被拋出。

self.features是一個由三個浮點數組成的列表ex。 [1.1，1.2，1.3] self.features的示例：

[array([-1.67191985, 0.1  , 9.69981494]), array([-0.68486623, 0.05  , 9.99085024]), array([ -1.36  , 0.1  , 10.44720459]), array([-2.46918915, 0.  , 3.5483372 ]), array([-0.835  , 0.1  , 4.02740479])]

在這裏被拋出的錯誤的方法。

def pca(self):   
    pca = PCA(n_components=2) 
    x_np = np.asarray(self.features) 
    pca.fit(x_np) 
    X_reduced = pca.transform(x_np) 
    plt.figure(figsize=(10, 8)) 
    plt.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], c=y, cmap='RdBu') 
    plt.xlabel('First component') 
    plt.ylabel('Second component')

完整的追溯是：

Traceback (most recent call last): 
    File "/Users/user/PycharmProjects/Post-Translational-Modification-     
Prediction/pred.py", line 244, in <module> 
y.generate_pca() 
    File "/Users/user/PycharmProjects/Post-Translational-Modification- 
Prediction/pred.py", line 222, in generate_pca 
plt.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], c=y, cmap='RdBu') 
File "/usr/local/lib/python3.5/site-packages/matplotlib/pyplot.py", 
line 3435, in scatter 
edgecolors=edgecolors, data=data, **kwargs) 
File "/usr/local/lib/python3.5/site-packages/matplotlib/__init__.py", 
line 1892, in inner 
return func(ax, *args, **kwargs) 
File "/usr/local/lib/python3.5/site-packages/matplotlib/axes/_axes.py", line 3976, in scatter 
c_array = np.asanyarray(c, dtype=float) 
File "/usr/local/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/numeric.py", line 583, in asanyarray 
return array(a, dtype, copy=False, order=order, subok=True) 
TypeError: float() argument must be a string or a number, not 'Pred'

來源

2017-07-30 vzg100

你能否發佈整個錯誤信息？這是所有的代碼還是有更多？ – 2Obe

你能不能也發佈幾行self.features？ – Linda

@ 2Obe增加了完整的回溯，有更多的代碼，但約200行。但是，我不認爲這是造成錯誤的原因。謝謝！ – vzg100

通過@WhoIsJack建議的解決方法是增加np.arange(len(self.features))

對於那些誰遇到類似問題的功能代碼：

def generate_pca(self): 
    y= np.arange(len(self.features)) 
    pca = PCA(n_components=2) 
    x_np = np.asarray(self.features) 
    pca.fit(x_np) 
    X_reduced = pca.transform(x_np) 
    plt.figure(figsize=(10, 8)) 
    plt.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], c=y, cmap='RdBu') 
    plt.xlabel('First component') 
    plt.ylabel('Second component') 
    plt.show()

來源

2017-07-31 19:43:19 vzg100

的Python 3.5想要繪製PCA與sklearn和matplotlib

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