如何使用graphviz通過networkx獲取圖形座標（佈局）？

我有一個包含3000個節點的圖。我試圖使用pydot佈局引擎來尋找一個更愉快的佈局比默認networkx佈局layout = nx.fruchterman_reingold_layout(G)如何使用graphviz通過networkx獲取圖形座標（佈局）？

的例子從neteorkx doc

G_tst = nx.complete_graph(4) 
pos = nx.nx_pydot.pydot_layout(G_tst) 
pos = nx.nx_pydot.pydot_layout(G_tst , prog='dot')

的作品就好了。然而，當我使用我自己的圖 pos = nx.nx_pydot.pydot_layout(G)我得到一個Type Error它聲稱G有不止一次attibute name。

--------------------------------------------------------------------------- 
TypeError         Traceback (most recent call last) 
<ipython-input-72-1326868cc786> in <module>() 
     1 
----> 2 pos = nx.nx_pydot.pydot_layout(G) 
     3 nx.draw(G, pos=pos) 

C:\Anaconda3\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_pydot.py in pydot_layout(G, prog, root, **kwds) 
    261  """ 
    262  import pydotplus 
--> 263  P=to_pydot(G) 
    264  if root is not None : 
    265   P.set("root",make_str(root)) 

C:\Anaconda3\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_pydot.py in to_pydot(N, strict) 
    200  for n,nodedata in N.nodes_iter(data=True): 
    201   str_nodedata=dict((k,make_str(v)) for k,v in nodedata.items()) 
--> 202   p=pydotplus.Node(make_str(n),**str_nodedata) 
    203   P.add_node(p) 
    204 

TypeError: __init__() got multiple values for argument 'name'

這裏是node attributes我有：

`G.add_node(G.number_of_nodes(), 
      name=endNode.endWord, # string 
      teaching_text=endNode.tt_corpus, # string 
      definition=endNode.domainDef, # string 
      search_string=endNode.searchKey_obj.search_key_str, 
      name_len = len(endNode.endWord))` #int

來源

2017-04-18 Itay Livni

我昨天得到了同樣的錯誤。我不是100％確定的，但似乎有些內部變量與您的屬性「名稱」相沖突。在我的情況下，我將它更改爲「name_」，然後它可以工作。

來源

2017-05-03 03:25:07 Xuan

如何使用graphviz通過networkx獲取圖形座標（佈局）？

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