2016-09-23 89 views
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我正在嘗試進行神經細胞橫截面的粒子分析。實質上,每根神經纖維都有外半徑和內半徑,我想計算環形區域。將圖像轉換爲二進制圖像非常簡單,然後分析粒子,但它只給出外部區域(包括內部區域)的區域。我想以某種方式自動找到外部區域(由黑色帶的外邊緣標記)區域減去內部區域(由黑色帶的內邊緣標記)。圖片與我在說的內容有關(該圖片是一個樣本,已經被轉換爲二進制文件)。有沒有辦法自動計算ImageJ中神經細胞的環狀區域?

[Nerve cell cross sections converted to binary in ImageJ]

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你應該先反轉形象,白色的圖案將要分析的內容。然後,您應用連接組件標籤以分離模式,然後您可以逐個分析它們。

不幸的是,我不認爲ImageJ中存在連接組件的標籤和分隔,但你可以看一下union-find算法,它非常簡單。這是一個java code