多序列比對

Question

我知道它可能看起來有點奇怪，但我想知道是否有人曾經看過一些JavaScript代碼爲multiple sequence alignment problem。如果沒有（如我所料）也有一些便攜式代碼（即我不需要廚房水槽）會做。請記住，我不會排列超過4-5個長度小於100-200個符號的序列。

注意：我知道JavaScript並不是真的這種事情的最佳選擇。相信我，我有一個很好的理由，爲什麼我必須用JavaScript來做到這一點。

Answer 1

我發現的最接近的事情僅僅是一個pairwise sequence alignment algorithm。我把它變成了可以做MSA的東西，但它肯定太慢，無法用於超過一百個符號的任何東西。

Answer 2

http://biostar.stackexchange.com/