2013-01-14 68 views
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我剛買了一臺顯微鏡的徠卡數碼相機。它附帶一個軟件拍照,並且校準圖片(像素每毫米),它可以測量長度並在文件中打印1mm的標尺,但我也想測量面積。 測量多邊形面積的插件應花費約1000歐元。開源程序來計算一個位圖的面積

所以我找了一個開源項目,它可以測量在jpgtifpng ...)文件中的多邊形的面積。

例如顯微鏡圖片顯示一隻蒼蠅的翅膀,我想點擊一個多邊形周圍的機翼用鼠標並獲得「4.32毫米^ 2」

如果沒有,我會得開始我自己的,但我相信這是一個常見問題,我在搜索引擎中使用錯誤的關鍵字。

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來衡量你如何定義的區域?如果您知道每個像素有多大以及有多少像素處於「開」狀態,則基本完成。 –

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你在尋找一些基本的數學(矩形區域)嗎? –

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像素沒有任何固有的物理尺寸。也許你可以從校準工具輸出的校準數據中得出像素的物理尺寸? –

回答

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您可以拍照並使用Fiji(ImageJ發行版)執行圖像分析。其他圖像分析工具Cellprofiler可以計算物體的特徵。

帶有堡盟光電適配器的Micromanager項目也可以用您的相機進行處理。也看看這software list

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我傾向於做的是使用開源矢量繪圖應用程序'inkscape'這種工作。

  • 導入圖像(文件 - >導入)
  • 得出你需要測量的多邊形(按Shift + F6)
  • 選擇從菜單擴展 - >可視化路徑 - >測量路徑...
  • 將比例因子設置爲您從校準中知道的比例因子
  • 將長度單位設置爲mm
  • 按'應用'。這將一個區域的指示作爲文本字段添加到繪圖