如何使用igraph python的metamagic類？

Question

igraph的Python界面有一個名爲metamagic的類，用於收集繪圖的圖形參數。我正在使用igraph編寫一個模塊，爲此我幾乎開始編寫自己的包裝函數，當我在文檔中找到metamagic時。但是在搜索和嘗試之後，仍然不清楚如何使用這些類。如果我定義一個AttributeCollectorBase類邊緣，就像這樣：

class VisEdge(igraph.drawing.metamagic.AttributeCollectorBase): 
    width = 0.002 
    color = "#CCCCCC44" 

那麼，有沒有一種簡單的方法來傳遞這些參數給igraph.plot()功能？或者我只能一個接一個，像這樣：plot(graph,edge_color=VisEdge(graph.es).color)？ 如果我想使用不是常量參數，而是通過自定義函數來計算呢？例如，vertex_size與度數成正比。 AttributeSpecification類的func參數應該這樣做，不是嗎？但我還沒有看到任何示例如何使用它。如果我定義一個AttributeSpecification情況下，像這樣：

ds = igraph.drawing.metamagic.AttributeSpecification(name="vertex_size",alt_name="size",default=2,func='degree') 

後如何將其傳遞給AtributeCollector，終於plot()？

Answer 1

（把事情放在上下文中：我是igraph的Python接口的作者）。我不確定metamagic包是否適合您。 AttributeCollectorBase類的唯一目的是允許igraph中的頂點和邊緣抽屜（請參閱igraph.drawing.vertex和igraph.drawing.edge包）以精緻和簡潔的方式定義它們可以視爲視覺屬性的頂點和邊屬性（沒有我打字太多）。所以，舉例來說，如果你看看在igraph.drawing.vertex的DefaultVertexDrawer類，你可以看到，我通過派生從AttributeCollectorBase構造VisualVertexBuilder類，如下所示：

class VisualVertexBuilder(AttributeCollectorBase): 
    """Collects some visual properties of a vertex for drawing""" 
    _kwds_prefix = "vertex_" 
    color = ("red", self.palette.get) 
    frame_color = ("black", self.palette.get) 
    frame_width = 1.0 
    ... 

後來，所使用的DefaultVertexDrawer時在DefaultGraphDrawer，我簡單構造VisualVertexBuilder如下：

vertex_builder = vertex_drawer.VisualVertexBuilder(graph.vs, kwds) 

其中graph.vs是圖表（因此頂點構建器可以訪問的頂點屬性）和kwds i的頂點序列是傳遞給plot()的一組關鍵字參數。然後，vertex_builder變量允許我通過書寫類似vertex_builder[i].color的方式檢索頂點i的計算的有效視覺屬性;在這裏，VisualVertexBuilder負責通過查看頂點並檢查它的color屬性以及查看關鍵字參數並檢查它是否包含來確定有效顏色。

底線是AttributeCollectorBase類只有在您實現自定義圖形，頂點或邊緣抽屜時纔會對您有用，並且您希望指定您希望將哪些頂點屬性視爲視覺屬性。如果您只想繪製一張圖並從其他數據中導出該特定圖的視覺屬性，那麼AttributeCollectorBase對您來說沒有用處。舉例來說，如果你想頂點的大小成比例的程度，要做到這一點是可以在本的首選方式：

sizes = rescale(graph.degree(), out_range=(0, 10)) 
plot(graph, vertex_size=sizes) 

或本：

graph.vs["size"] = rescale(graph.degree(), out_range=(0, 10)) 
plot(g) 

如果你有許多視覺上的性能，最好的方法可能是首先將它們收集到字典中，然後將該字典傳遞給plot();例如： -

visual_props = dict(
    vertex_size = rescale(graph.degree(), out_range=(0, 10)), 
    edge_width = rescale(graph.es["weight"], out_range=(0, 5), scale=log10) 
) 
plot(g, **visual_props) 

看看在rescale功能的更多詳細信息的文檔。如果您希望映射一些頂點屬性到頂點的顏色，你仍然可以使用rescale到屬性映射到0-255的範圍內，那麼他們周圍到最接近的整數，並使用一個調色板打印時：

palette = palettes["red-yellow-green"] 
colors = [round(x) for x in rescale(g.degree(), out_range=(0, len(palette)-1))] 
plot(g, vertex_color=colors, palette=palette)