cytoscape

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    [R WGCNA Cytoscape的樞紐基因

    我有 WGCNA以下問題 - http://labs.genetics.ucla.edu/horvath/htdocs/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/ 工作的第1.6節，網絡外部軟件出口（的Cytoscape） 我目前正試圖執行關於一組基因的WGCNA，我無法獲得每個模塊的頂部x中心基因。我正在嘗試將網絡導出到Cytoscape，並使用
    r attributes count genetics cytoscape 2012-10-29

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    使用cmd和Python在Cytoscape中打開一個網絡文件

    所以我有一個python腳本生成一個networkx圖並將其導出爲.graphml，我希望腳本也能夠打開cytoscape，並且加載的網絡沒有任何工作用戶部分。我明白了： cytoscape.bat -N C:\Somepath\with\a\networkx.graphml 它在我使用它時正常工作。一樣： cd "C:\Program Files\Cytoscape_v3.0.0" cyt
    python batch-file cmd cytoscape 2013-07-15

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    如何在Cytoscape（或任何JavaScript）樹中繪製餅圖

    我使用Cytoscape javascript繪製樹。 問題是我想在節點中顯示很多值，所以我們決定繪製餅圖而不是它的原始圓來代表許多值。但我不知道如何在一個節點上繪製餅圖。 我發現這個CanvasJS 請告訴我如何得出這個餅圖在另一個JavaScript（Cytoscape的）。 或任何替代解決方案 謝謝。
    javascript html cytoscape-web cytoscape cytoscape.js 2013-06-03

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    我需要在點擊節點時激活的超鏈接代碼？

    我必須查看我的數據作爲一個可視化的網絡格式，所以使用cytoscape網頁。我使用示例鏈接http://lekshmideepu.blogspot.in/2012/03/cytoscape-web-examples.html來繪製具有不同顏色節點和邊緣的網絡，它爲節點/邊緣提供顏色和大小。我需要爲每個節點設置一個更多的事件超鏈接。請在網絡中使用點擊事件節點作爲超鏈接？ <!DOCTYPE html
    javascript tooltip cytoscape cytoscape-web 2013-07-24

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    在細胞景觀插件中使用jung2

    爲了編寫cytoscape插件並使用jung2來分析和操縱細胞景觀圖對象，我已經花了約一週半的時間來研究Java。有什麼辦法可以擴展cytoscape graph對象，把它稱爲class xyz，以包含jung2圖形類型對象的新字段，其字段和方法指向cytoscape中相應的對象，而不會在內存中創建一個全新的對象。不知道我在做和感知在這裏，但假設比如我有兩個班級代表同一類型的對象 public c
    java jung cytoscape jung2 2013-07-27

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    如何在Cytoscape中自動執行[load + export]操作？

    我有~100 * .xgmml文件，每個文件指定一個不同的網絡。我如何通過Cytoscape爲每個輸入文件自動生成PNG圖像文件？ （該Cytoscape的命令行選項包括一些加載文件，但我沒有看到任何的出口網絡爲圖像文件。）
    cytoscape 2013-01-12

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    如何使用transform：使用Cytoscape.js在CSS中旋轉？

    如何使用CSS的屬性造型餅圖等，1，2 .pie { position: absolute; width: 100px; height: 100px; -moz-border-radius: 50px; -webkit-border-radius: 50px; -o-border-radius: 50px;
    css css3 cytoscape-web cytoscape.js cytoscape 2013-06-12

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    Cytoscape 3.0 Bundle應用程序

    我試圖創建一個新的Cytoscape 3.x應用程序Create a Bundle App Using IDE教程沒有運氣。 本教程是很容易做到，但是當我運行的Cytoscape找出如果我的應用程序正在運行，我可以看到，它被列爲安裝但它不是活動。 我我錯過了什麼？
    cytoscape 2013-05-08

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    Cytoscape.js大數據性能vs sigma.js

    我在使用〜1,000個節點和〜5,000個邊的cytoscape.js中繪製圖時遇到了很多麻煩（需要很長時間才能渲染，一旦無法進行交互因爲瀏覽器已經過載），但是相同尺寸的圖表顯示效果很好，並且與sigma.js一起工作良好（http://sigmajs.org/）。 我想知道爲什麼兩個庫中存在如此巨大的性能差異。如果可能的話，我想使用cytoscape.js，因爲它看起來更好記錄並且更容易處理，但
    javascript performance cytoscape.js cytoscape 2013-06-28

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    如何使用networkx或其他方式爲我的數據（複雜網絡）製作令人滿意的佈局

    我想要可視化我的數據。 我的數據是這樣的：我的數據文件是：https://gist.github.com/anonymous/5568836 4556 5092 0.7000 4556 4785 0.7500 4556 5397 0.7000 4556 5139 0.7500 4556 5937 0.8333 4556 6220 0.7000 4556 5139 0.7500 455
    python networkx cytoscape 2013-05-13
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