cytoscape

0熱度

1回答

後，我初始化Cytoscape的東西，看起來像下面這樣： var cy = cytoscape({ container: $('#my-element'), height: 500px }); 我想容器元素的改變高度比原來500px值以外的東西時用戶提交一個動作。我該怎麼做Cytoscape？主Cytoscape對象中有一個height()方法，但它只能作爲getter

0熱度

2回答

如何在聚合物元素中使用細胞色素？

這是我的聚合物元件： <link rel="import" href="../polymer/polymer.html"> <script src="bower_components/cytoscape/dist/cytoscape.js"></script> <dom-module id="dependency-graph"> <template> <style>

0熱度

1回答

使用Cytoscape.js在所有節點上執行Centrality函數

我需要計算degree，圖中每個節點的接近度和中間度中心性。我正在使用cy.ready()事件之後的每個節點上內置到Cytoscape.js中的函數。但是，由於圖形相當大（250+節點，650+連接），計算時間太長。任何人都可以提出更有效的方法嗎？ var calculateSNA = function() { // Don't run if already set... if

0熱度

1回答

在Cytoscape.js中，如何在數據更改後觸發節點重繪？

有誰知道如何觸發節點重繪？我有一個情況，底層數據對象更新其「標籤」屬性，我可以觸發cytoscape重繪標籤的唯一方法是; 在節點上調用.selectify()然後.unselectify()的某些組合。替換標籤使用.data('label', ...) - 我實際上用自己替換它。這兩個都感覺有點不好意思，我想我錯過了API中明顯的東西。誰能幫忙？謝謝，瑞恩。

0熱度

1回答

如何在細胞視野中將網絡變成蛋白質形狀？

我有一個蛋白質網絡加載到cytoscape。我想將網絡節點變成與蛋白質形狀/結構相對應的形狀。這樣就可以將網絡圖像疊加到蛋白質結構圖像上。我試過RINanalyzer和structureviz2，但沒有幫助。任何解決方案

0熱度

2回答

隱藏並顯示節點上的子節點點擊Cytoscape

我正在嘗試使用breadthfirst佈局在Cytoscape中創建可摺疊的樹結構，以複製D3 collapsible tree。我試圖複製這種類型的節點上的點擊動作，但加入除了恢復功能 - Images & breadthfirst layout 我選擇的Cytoscape是因爲我有一個場景中的樹都結點超過1的原因家長。我曾嘗試使用下面的代碼添加點擊事件： cy.on('tap', 'nod

1熱度

3回答

我如何獲得對Cytoscape畫布上下文的參考？

我需要對Cytoscape Canvas對象的引用，它是2D上下文。我怎樣才能做到這一點？我在畫布上看不到任何「id」屬性。感謝

1熱度

2回答

導出大熊貓數據幀作爲相互作用的文件：行\噸值\噸COL

隨着下面PD數據幀： print(df) A B C X 1 2 3 Y 4 5 6 Z 7 8 9 我需要創建一個簡單交互網絡文件，或SIF文件，該格式的： node1 xx node2 node1 xx node2 node1 yy node2 . . . 其中每一行是df：行標籤，值，列標籤上的交互。下面是一個迭代（幼稚）的方法來編寫這樣的文件： with

0熱度

1回答

Cytoscape-從表中導入期間添加節點屬性

在cytoscape中，有一種從表導入網絡時導入節點屬性的方法。它明確指出藍色的列將被加載爲邊緣屬性，但沒有提及與節點屬性相對應的內容。

0熱度

1回答

有沒有辦法在非圖形（無視圖）模式下運行Cytoscape？

我試圖使用Cytoscape的命令行來運行一個腳本，進口和出口的網絡，如下所示： cytoscape.bat -S "script_for_cytoscape.txt" 該腳本，並執行所需的任務，但是，Cytoscape中顯示，我們可以看到網絡和GUI。我想運行它作爲後臺作業而不顯示Cytoscape。我試過「-noView」選項，但它不起作用。所以我想知道是否有一種方式在非圖形（無視圖）