mixed-models

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    模型規格與glmer

    我正在嘗試建立一個GLMM，但我有問題表達R與glmer分層數據結構。我的數據結構如下： y (dependent variable); visit (L1: nested independent variable); year (L2: nested independent variable); site (L3: independent variable); 其中visit嵌套在ye
    r lme4 mixed-models 2014-07-09

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    如何在afex函數中報告混合（MODEL）的結果？

    我在R來此公式： > mixed3 <- mixed(peak_Mid ~ (1|item) + (1+vowel3|speaker) + sex*vowel3*Language, data=data1.frame, na.action=na.omit) Fitting 9 (g)lmer() models: [.........] Obtaining 8 p-values: [Note:
    r linear mixed-models p-value 2014-09-01

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    如何爲視覺表示繪製二元混合效果模型

    我想繪製一個二進制混合效果模型的結果在視覺表示中的一篇論文。 我使用LME以適應混合模型： M2 <- lme(Pass ~ zone.time + length + Fat, random =~ 1 | Year) 通行證=二進制1/0 zone.time，長度&脂肪=連續 得到： Linear mixed-effects model fit by maximum likelih
    r ggplot2 binary mixed-models nlme 2014-09-02

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    多項式混合logit模型mlogit r-package

    我發現mlogit-package爲多項logit模型尋找估計多項混合logit模型。在閱讀完美的小插圖後，我發現我無法將數據應用於任何描述的示例。 我現在寫的希望對我的問題有幫助，並創建了一個最小的例子來說明我的情況。 問題如下： 在某處有輔音「Q」的詞。現在，一個試驗人員負責聽這些單詞，並說如果他們聽到Q，U或其他輔音。這必須根據音節位置或真實/非真實詞等因素進行建模。 在最小的例子中，我創建
    r mixed-models multinomial mlogit 2014-02-25

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    如何解釋glmer上具有顯着交互項的模型的p值？

    我正在測試兩個棲息地（入侵和未入侵）和三種不同柱頭類型（溼，乾和半乾）之間花粉沉積的差異。這是一種社區方法，每個站點的樣本和物種數量不平衡，數據的非正態分佈，最終得到一個嵌套的隨機結構，用γ誤差分佈來處理僞複製和非獨立性。 要找出最好的模型，我用似然比檢驗，顯示與固定效應的相互作用會更適合的模式： > m1b<-glmer(nb~habitat*stigmatype+(1|sitecode/sti
    interaction mixed-models p-value 2014-09-12

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    兩個隨機條款與NLME

    我執行與nlme包河混合模式我的情況是： 混合模式是： MY = DFC + DFC2, random=~DFC|Animal, data=my_data) 其中Animal是隨機效應。然而，如果我寫這樣的模型，我只能獲得隨機截取，並且傾斜DFC（Animal），但不是DFC2。 我想也有DFC2隨機斜率（Animal）！ 你能幫我嗎？ 非常感謝你，
    r mixed-models nlme 2014-01-12

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    廣義線性混合模型中的事後檢驗：怎麼辦？

    我正在使用R中的混合模型（glmmadmb）計數數據。我有一個隨機因素（地點）和一個固定因素（人居）。固定因素有兩個層次，隨機因素有七個層次。我想在七個隨機因子水平中的每一個水平上對固定因子的兩個水平進行比較。但是我不知道如何在R中做到這一點。我對R非常陌生。任何人都可以幫助我嗎？非常感謝。 這是我在分散的數據GLMM公式： model<-glmmadmb(Species.abundance~Ha
    r count nested mixed-models 2014-09-20

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    瞭解rlme4中混合模型的警告消息

    我已經在lme4軟件包中構建並運行了一個混合效應邏輯迴歸模型，用於評估不同位置（細胞/棲息地）中魚類佔用的概率。數據框架包括687條魚的1,207,140條觀察數據。對於每個人（每天約1年），它描述了每個獨特位置相對於所有位置的總髮生次數的發生次數。 這是基礎型號： m.base = glmer(cbind(N,t.move-N) ~ jdate + snSurface.Area + Restor
    r lme4 mixed-models 2014-06-13

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    提取係數和從LME

    它們的標準誤差如何可以提取係數與它們對於每個實驗單位（曲線）分別標準誤差（B0和B1）的線性混合模型，如這一個： Better fits for a linear model 與此相同的數據集（DF），並擬合模型（fitL1）：我怎麼可能得到一個數據幀這個...... plot b0 b0_se b1 b1_se 1 2898.69 53.85 -7.5 4.3 ... .
    r mixed-models nlme coefficients 2014-10-05

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    在混合效果中指定變異結構R中的Cox模型

    我使用函數coxme()在coxme軟件包中擬合R中的混合效果Cox模型。在我的模型中，我有一個審查生存時間$ X $，一個單一的協變量$ Z $和一個分組變量$ Group $。有一個隨機的截距和一個隨機的斜率，即我擬合了模型$ \ lambda（t | Z，b_0，b_1）= \ lambda_0（t）e^{\ beta Z + b_0 + b_1 Z} $。 我想指定隨機效應的協方差矩陣的結
    r mixed-models cox-regression 2014-03-27
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