openmpi

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我在HPC上運行doMPI，我想記錄來自工人的輸出。使用doParallel，我可以使用makeCluster(outfile='myfile.log')。使用doMPI，在任何方法中似乎都不存在任何參數。我嘗試使用sinkWorkerOutput()。這是有效的，但只爲其中一名工作人員寫了日誌。我懷疑每個工人都在重寫另一個工人。 outfile doMPI有模擬嗎？一個相關的問題 - 在一個工

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與多對多處理器通信時發生MPI錯誤

我正在編寫一個代碼，其中每個處理器必須與多個處理器交互。例如：我有12個處理器，所以處理器0必須通信說1,2,10和9.讓我們稱它們爲處理器0的鄰居。同樣我有處理器1必須通過說5，3 。處理器2必須與5,1,0,10,11 等通信。數據流是2種方式，即處理器0必須發送數據到1,2,10和9，並且也從它們接收數據。另外，標籤計算中沒有問題。我創建了是這樣的代碼： for(all neigh

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使用Open MPI和OpenMP進行並行處理

這可能是一個愚蠢的問題，無論如何，我正在處理一個令人尷尬的並行問題。我可以將工作分成可以並行執行的獨立任務（無通信）。在外殼script.sh可以使用以下命令： #!/bin/bash let MY_ID=${OMPI_COMM_WORLD_RANK} ./a.out $MY_ID 在prog.c我們有一個簡單獨立的程序： #include <string.h> #include <s

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「libquadmath.la」不是一個有效的libtool檔案」與gfortran

配置的openmpi當我試圖配置我的openmpi與FORTRAN，gfortran，這就是我已經配置我的MPI。 ./configure --prefix=/usr/local/openmpi/2.0.1 --enable-mpi-fortran --enable-mpi-cxx --enable-mpi-thread-multiple 我在製作階段出現此錯誤。 /usr/local/gn

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運行mpirun時無效的數據類型

我有一個簡單的程序，我想在多臺計算機上分散結構，但似乎我已經錯誤地定義了數據類型，即使程序編譯正常。我有以下代碼。 #include <mpi.h> #include <stdio.h> #include <stdlib.h> typedef struct small_pixel_s { double red; double green; double blu

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在Ubuntu 16.04上安裝Rmpi VirtualBox

我在VM VirtualBox上創建了一個新的ubuntu-16.04.2-desktop-amd64機器，我希望能夠在Rmpi中使用R環境。以下兩種方法都會給出類似的錯誤。更新簡化預建立的二進制方法：當Ubuntu的已安裝的I開了一個終端並執行以下命令： ~$ sudo apt-get update ~$ sudo apt-get install openmpi-bin ~$ sudo

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如何獲得MPI中的所有等級來發送一個值爲0，然後在所有等級上進行阻止接收？

說我有n個過程：他們做一個計算，然後發送結果排名爲0。這是我希望發生的：等級0將等待，直到它從結果所有的隊伍，然後加起來。我該怎麼做？另外，我想避免以下內容：例如， 4個進程P0，P1，P2，P3， P1 -> P0 P2 -> P0 P3 -> P0 與此同時P1已完成其計算等P1-> P0再次發生。我希望P0只在一個週期內完成3個過程的添加，然後再爲下一個週期做3個過程。有

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在同一函數中調用MPI_Barrier兩次可以嗎？

在C中使用OpenMPI; 說我有 main() { MPI_Init(); //// Important Program Region MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); // do something here MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); //// MPI_Finalize(); } 這是不好的做法？我能像這樣

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doMPI錯誤：系統中沒有足夠的插槽可用於滿足應用程序請求的2個插槽

我試圖讓我的本地機器上運行doMPI程序包，以便我可以在它之前對其執行測試將作業提交給羣集。我正在使用Mac OSX Yosemite並通過brew安裝了開放的mpi 2.0.2。 mpirun -V mpirun (Open MPI) 2.0.2 Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/ 我已閱讀過引進了doMPI我試圖在演示

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ZeroMQ vs OpenMPI

有人可以提供什麼更好，哪些情況？我有一些ZeroMQ的經驗（不是很多），沒有OpenMPI的經驗。我知道這兩個都是消息傳遞的框架。這兩個框架的主要區別是什麼？