openmpi

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我正在處理帶有MPI並行化的Fortran代碼，在該代碼中，我的內存不足以進行密集運行。我很小心地分配幾乎所有在模擬開始時所需的內存。子程序靜態內存分配通常很小，但如果由於這些子程序而導致內存不足，則會在模擬的早期發生，因爲內存分配不應該隨着時間的推移而增長。我的問題是，遠到仿真，我遇到了內存不足的錯誤，如： Insufficient memory to allocate Fortran RTL

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在Google雲羣集上安裝OpenMPI

我希望在我的羣集的所有節點上安裝OpenMPI。到目前爲止，我一直在每個節點上分別安裝OpenMPI。也就是說，我有4個節點連接到每個節點並在其中安裝OpenMPI，這非常耗時且雜亂。有沒有辦法安裝它並在所有羣集節點中共享它。或者任何其他較短的程序。任何有關這方面的知識是讚賞。

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如何正確使用MPI_Gather？

我讀過關於mpi，我有興趣使用函數MPI_Gather。現在我這樣做，但它不工作： #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include <mpi.h> char *funcion (char *a) { sprintf(a, "asdfa%u", 2); } int main (int

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用MPI_Gather收集字符串openmpi c

我想爲每個進程生成一個字符串，然後收集所有內容。但是在每個過程中創建的字符串都是通過追加int和chars來創建的。我仍然無法正確收集所有內容。我可以逐個打印所有部分字符串，但是如果我嘗試打印rcv_string，我只會得到一個部分字符串或者可能是分段錯誤。我已經嘗試在memset的字符串的末尾放置零，動態和靜態地爲字符串保留內存......但我沒有找到方法。如果有人知道如何初步化弦併爲實現

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有人可以用開放的mpi解釋這個valgrind輸出嗎？

我有一個應用程序使用OpenMPI並在Windows和Linux上啓動它。 Windows的版本工作正常，但是，在Linux上運行導致內存分配錯誤。某些應用參數會出現問題，需要更多計算。爲了消除內存泄漏，我使用Valgrind檢查了Linux版本的應用程序，並得到了一些output。畢竟，我試圖搜索關於輸出的信息，並在堆棧溢出和GitHub上發現了一些帖子（沒有足夠的信譽來附加鏈接）。畢竟，我更

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MPI_Wtime定時器在OpenMPI 2.0.2中運行速度提高2倍

將OpenMPI從1.8.4更新到2.0.2後，我使用MPI_Wtime（）進行了錯誤的時間測量。在版本1.8.4中，結果與omp_get_wtime（）計時器返回的結果相同，現在MPI_Wtime運行速度提高了約2倍。什麼會導致這樣的行爲？我的示例代碼： #include <omp.h> #include <mpi.h> #include <stdio.h> #include <std

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如何設置幾個數量混合動力車OPENMP線程/ MPI程序

我寫混合OPENMP/MPI程序和予這樣稱呼它下面 mpirun -np ncores --bind-to none -x OMP_NUM_THREADS=nthreads ./program 其中ncores是非共享存儲器進程的數量（MPI ），nthreads是共享內存線程數（OpenMP）。這意味着在每個ncore中，程序將在nthread上執行。我不想在每個核心中都有nthread

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使openmpi-2.0.2工作的問題。（MacOS Sierra）

已經嘗試在運行在OSX Sierra 10.12.3上的Mac上安裝openmpi-2.0.2，每次都有類似的結果。使用安裝如下： $ CD了openmpi-2.0.2 $的./configure --prefix =在/ usr /本地 $讓所有 $ sudo的使安裝安裝後想使用測試： $的mpirun -n 4主機名 & $ mpiexec的-n 4主機名都導致： ORTE_ERROR_

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Python的終端呼叫不會加載適當的庫

我正在運行的程序，它利用在Fedora 20. 所述的openmpi庫當我從終端運行命令： ../bin/boxfit ../settings/boxfitsettings.txt | tee boxoutput.log 它是成功的。當我通過Python控制檯運行它返回一個錯誤：同樣的錯誤結果與 subprocess.call(args,shell=True) 我有路徑設定相同的

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如何從srpm創建openmpi rpm cuda知道

我想從srpm創建OpenMPI 1.10.2 rpm。但我需要建立它cuda知道。據我需要添加./configure --with-cuda 的文檔（https://www.open-mpi.org/faq/?category=buildcuda）有沒有辦法做到這一點，同時創造了轉？我想： rpmbuild -bb --with cuda openmpi-1.10.2.spec rpmbu