openmpi

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假設你做了兩個MPI_Sends和兩個MPI_Recvs，你可以指定哪個緩衝區的內容將會到達MPI_Send，如果你有兩個不同的緩衝區可用，並且每個MPI_Recvs都從每個緩衝區接收？ if(rank == MASTER) { for(kk=1; kk < size; kk++) { MPI_Recv(printbuf, numcols, MPI_DOUBLE, kk, t

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mpi4py不加速embarrisingly可並行化的代碼

我想在6核英特爾至強機上使用numpy.linalg和openmpi/mpi4py對大量完全獨立的矩陣計算進行對角化。當使用N個進程運行時，每個矩陣計算似乎需要延長N倍，因此計算的總時間與非並行版本相同（實際上比較慢）。 E.g.這裏有一個簡單的代碼，僅僅對角化12個1000×1000的隨機矩陣： import numpy as np import numpy.linalg as la im

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Mpi_File_iwrite寫入失敗; aio_write（）錯誤：無效參數

if(my_rank==0) { sprintf(str,"<?xml version=\"1.0\" ?>\n"); MPI_File_iwrite(fp,str,strlen(str), MPI_CHAR,&request); a=a+strlen(str); sprintf(str,"<!DOCTYPE Xdmf SYSTEM \"X

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MPI_Get_count中的未知MPI_Datatype

我想將struct S的幾個實例發送到某些進程。每個struct的佈局可能不同，也就是說，s.v可能有不同的大小。在接收數據時，我不知道MPI_Get_count中的確切MPI_Datatype，因爲該信息僅在發件人進程中可用。還要考慮到struct S有很多非原始成員，所以我不能假設接收時MPI_Datatype爲MPI_INT。我如何獲得用於MPI_Get_count的MPI_Datatype

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MPI pi計算中的節點數無效

我正在嘗試並行計算pi的下列代碼。我的方法是使用scatter來並行化for，然後使用reduce來計算總和值並最終顯示pi。我的代碼如下 #include <stdio.h> #include <mpi.h> long num_steps = 100000; double step = 1.0/100000.0; int main() { int i, myid, size;

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當尺寸變大時會出現矩陣計算錯誤

我正在運行一個代碼，我簡單地創建了2個矩陣：一個矩陣的尺寸爲args x nsame，另一個矩陣的尺寸爲nsame x bcols。結果是一個尺寸爲x bcols的數組。這是相當簡單的使用BLAS來實現，並出現下面的代碼如期運行使用具有的openmpi下面的主從模式時：` #include <iostream> #include <stdio.h> #include <iostream> #

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HDF5的未定義符號ompi_mpi_info_null - Ubuntu 16.04

我試圖在Ubuntu 16.04中編譯需要HDF5的包。編譯HDF5時遇到這個問題： ImportError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5_openmpi.so.10: undefined symbol: ompi_mpi_info_null 這是說明我沒有openMPI？很確定我有這個以及從突觸檢查...我已經安裝了libopenmpi-dev和lib

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MPI_Recv中的不尋常案例！接收數組的最後三個元素是錯誤的？

更新版本我發現了導致問題的部分，這在之前解釋如下。我也想和你分享這個情況。我意識到，我所做的只有一個荒謬的錯誤。但是，我想知道這個問題是如何發生的，即使我犯了一個很大的錯誤：我有一個結構定義如下; #define FP_TYPE double /* Struct : Nonzero */ struct nonzero{ int row_index; int col

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doMPI和羣集

我有我的第一次使用R和羣集的經驗。在Google上搜索時，我發現了包「doMPI」。這個包允許我自動化創建進程。但是，我對功能有點混淆。 1 - startMPIcluster和registerDOMPI有什麼區別？ 2 - 在startMPIcluster上傳遞的爭論是什麼？ 3 - 當我使用命令「mpirun -H n1，n2，n3 -n 1 R -slave -f sincMPI.R」時，它

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MPMD MPI執行中的通信

此帖與以前發帖binding threads to certain MPI processes有關。在這裏，有人問及MPI等級如何分配不同的OpenMP線程數量。一種可能性如下 $ mpiexec <global parameters> -n n1 <local parameters> executable_1 <args1> : -n n2 <local param