protein-database

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哪些商業數據庫擅長存儲蛋白質/ DNA序列等生物序列？有沒有專門爲存儲這種序列而設計的？歡呼聲

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我正在研究一個項目（我必須在Perl中實現它，但我不擅長）讀取DNA並找到它的RNA。將該RNA分成三聯體以獲得其相應的蛋白質名稱。我將解釋以下步驟： 1）轉錄以下DNA的RNA，然後使用遺傳密碼翻譯成的氨基酸序列實施例： TCATAATACGTTTTGTATTCGCCAGCGCTTCGGTGT 2）轉錄的DNA，第一替換各DNA爲它的對應物（即，G爲C，C爲G，T爲A和A爲T）： TCAT

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pdb蛋白庫格式 - 配體去除

我想從PDB記錄中去除各種配體。它只是足以刪除HET，HETNAM，HETATM ....，即。那些在哪裏用3字母代碼標識化合物，還是有必要清理其他一些領域？是否有任何python | perl腳本已經爲此寫作？

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使用OpenGL和C++渲染蛋白質功能區圖的OpenGL代碼

我正在尋找使用OpenGL和C++渲染蛋白質功能區圖。有沒有人知道這個開源代碼是否已經存在，或者是否有很好的指導來做到這一點？如果沒有，我寧願自己弄清楚;）但我不想重新發明輪子，特別是如果輪子是空閒的。編輯：謝謝你的迴應。有沒有人知道這些程序是否有很好的文檔說明爲什麼它們存儲某些頂點或三角形網格以便根據蛋白質中原子的結構進行渲染？

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蛋白質結構可視化

我被要求研究蛋白質結構可視化，像RasMol，其中用戶將打開一個pdb文件來獲取蛋白質結構。如何從pdb文件生成蛋白質結構？我想在Python中編寫代碼並使用OpenGL或VTK可視化結構？在這方面有沒有其他模塊可以幫助我？