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對於PDB數據庫中給定的一組pdb格式的蛋白質結構,我想找一些自動化的方法來檢查每個結構是單體,二聚體還是三聚體等,所以我只能獲得每種情況下的單元結構或單體。我會談論biopython,但我不確定是否還有其他方法。以自動化的方式獲取蛋白質單體
對於PDB數據庫中給定的一組pdb格式的蛋白質結構,我想找一些自動化的方法來檢查每個結構是單體,二聚體還是三聚體等,所以我只能獲得每種情況下的單元結構或單體。我會談論biopython,但我不確定是否還有其他方法。以自動化的方式獲取蛋白質單體
看起來第一步是訪問PDB數據庫。我不熟悉biopython,但是從文檔看起來它不僅具有內置的數據庫接口,用於下列:
你知道你將如何連接到PDB數據庫嗎?