我想從特定的生物項目NCBI數據庫檢索編碼蛋白質序列。這可以通過Web瀏覽器以某種方式實現。例如，您可以找到您感興趣的特定生物項目，並在關聯蛋白質上點擊「咔嗒」： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/proteins/994?project_id=207383，它們允許您查看BioProject「207383」和Genome「994」中的所有蛋白質。我想用python自動獲取thoses蛋白質序列。Ncbi蛋白質數據庫，如何從特定的生物學項目獲取蛋白質序列（python腳本）
爲了做到這一點，我使用了NCBI的「電子工具」。主要是「elink.fcgi？」它允許從數據庫的特定UID（可以說是BioProject UID）獲取數據庫的所有UID（可以說是「Protein」）。所以這裏是我的entrez的URL請求：
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=bioproject&linkname=bioproject_protein&id=207383
然後，我得到一個蛋白質UID的列表，這是偉大的，因爲我需要這些，我的下一個請求與efetch.fcgi？ 「E-效用」。這個請求會讓我得到我需要的一切。
好的，所以一切都很好，所有的工作都很好但是，我從我的「elink.fcgi？」得到的蛋白質UID的數量。請求與基於手動網絡瀏覽器的搜索顯示的蛋白質數量不同。更糟糕的是，在查詢這些問題的起源時，您會看到來自更高分類羣的缺失序列或序列（它們與BioProject沒有任何關聯）。
這裏是一個例子：當python請求得到3957蛋白質UID時，這篇文章的第一個鏈接顯示4014個序列的數量。
我嘗試了一些其他方法，例如獲取從分類標準UID鏈接的所有蛋白質UID。這通常會給你更多的順序比想要的，因爲有不同的生物工程（也給你一些雙打不同的名字和相同的Fasta）。
有沒有辦法做到這一點，遷移工作？