類似的pubmed文章通過pubmed api

Question

是否有可能獲得類似的pubmed文章給予pmid。示例link在權利方面顯示了類似的文章。

Answer 1

您可以使用BioPython使用NCBI API來做到這一點。您正在尋找的命令是neighbor_score。或者，您可以直接通過URL獲取數據。

from Bio import Entrez 

Entrez.email = "Your.Name.Here@example.org" 
handle = Entrez.elink(db="pubmed", id="26998445", cmd="neighbor_score", rettype="xml") 
records = Entrez.read(handle) 

scores = sorted(records[0]['LinkSetDb'][0]['Link'], key=lambda k: int(k['Score'])) 
#show the top 5 results 
for i in range(1, 6): 
    handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id=scores[-i]['Id'], rettype="xml") 
    record = Entrez.read(handle) 
    print(record)