2014-11-03 82 views
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假設我的數據包含3個類別。我想找到每個類別的協方差矩陣,並期望返回是一個數組。如何在data.table中按類別查找協方差矩陣R

set.seed(7)  
x <- rbind(cbind(rnorm(120,-1,0.1), rnorm(120,-0.5,0.1)), 
       cbind(rnorm(120,-0.4,0.1), rnorm(120,0,0.1)), 
       cbind(rnorm(120,.2,0.1), rnorm(120,0,0.1))) 
lab <- c(rep(1, 120), rep(2, 120), rep(3, 120)) 
newx <- cbind(x, lab = lab) 
s <- sapply(1:3, function(k){ var(newx[lab == k, -3]) }) 
dim(s) <- c(2,2,3) 

回報,

, , 1 

      [,1]   [,2] 
[1,] 0.008880447 -0.001116058 
[2,] -0.001116058 0.009229061 

, , 2 

      [,1]   [,2] 
[1,] 0.012193536 -0.001217923 
[2,] -0.001217923 0.009391710 

, , 3 

      [,1]  [,2] 
[1,] 0.010752319 0.0
[2,] 0.0.008226595 

我知道如何使用sapply做到這一點,但如果我想使用data.table,我該怎麼辦呢?

我曾嘗試:

library(data.table) 
dt <- data.table(newx) 
dt[,lapply(.SD, var), by = lab] 

,但如我所料不提供回報。

+0

你想要什麼輸出?一個數據表是一個數據框,而不是一個三維數組。 – rawr 2014-11-03 03:23:11

+0

@rawr我想要的輸出是包含每個類別的協方差的上述數組。在這種情況下,我有3個類別,所以我期望有3個協方差矩陣。 – newbie 2014-11-03 04:16:20

回答

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如果你需要結果作爲一個三維矩陣,那麼顯然這不是一個data.table。但是,您可以使用data.table進行計算。

library(data.table) 
DT <- as.data.table(newx) 
result <- DT[,var(.SD),by=lab] 
result <- as.matrix(result$V1) 
dim(result) <- c(2,2,3) 
result 
# , , 1 
# 
#    [,1]   [,2] 
# [1,] 0.008880447 -0.001116058 
# [2,] -0.001116058 0.009229061 
# 
# , , 2 
# 
#    [,1]   [,2] 
# [1,] 0.012193536 -0.001217923 
# [2,] -0.001217923 0.009391710 
# 
# , , 3 
# 
#    [,1]  [,2] 
# [1,] 0.010752319 0.0
# [2,] 0.0.008226595