imagej

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    ![1] 我一直在試圖分析一段時間的圖像。它是在一些HeLa細胞暴露於超聲波50ms後獲得的。無論如何,我可以使用imageJ來分析細胞數據嗎?我試過使用正常的圖像 - >調整 - >閾值。一直沒有工作得太好,有什麼建議嗎? 你可以在這裏的形象:https://drive.google.com/file/d/0BzKbcezW-5hYNElaUXZHT3dGa2s/view?usp=sharing

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    我有下面的代碼,當我嘗試關閉ROI管理和蒙太奇在其結束工作只是罰款我得到的錯誤: There are no images open 我開始不指定窗口,然後嘗試指定窗口,嘗試run("Close");,只是close();。 ROI管理器和蒙太奇都會用當前的宏關閉,但會彈出消息。我在這裏做錯了什麼? macro "draw rois [v]"{ var list="/Volumes/bko

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    我的大部分時間都昨日試圖找出我的pom.xml文件用什麼,所以我可以得到我需要沒有從ImageJ的父POM繼承ImageJ2庫。我想通了以下設置,但他們遠遠沒有達到最佳: ... <repository> <id>imagej.public</id> <url>http://maven.imagej.net/content/groups/public</url>

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    我正在使用Python來設計一個軟件,並且圖像處理是其中一個步驟。我正在使用ImageJ來實現這一點。 由於ImageJ中有一個Jython解釋器,可以在ImageJ軟件中打開,所以必須有一種方法將ImageJ連接到Python並調用Python中的所有函數。 我想知道如何才能完成Python中的所有處理,而不是在ImageJ中打開解釋器?

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    我想添加一個比例尺到ImagePlus,但我不能。當我使用Windows我用下面的命令: IJ.selectWindow("window_name"); IJ.run("Set Scale...", "distance=1 known="+pixelSize+" pixel=1 unit=um"); IJ.run("Scale Bar...", "width="+barSize+" heigh

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    此刻我使用ImageJ(與我的Ubuntu 14.04)手動添加比例尺到圖像(半手動準確地爲我使用「文件→導入→圖像序列...」)。 我錄製一個宏(通過ImageJ中:插件→宏→錄製...)(如下所示): run("Blobs (25K)"); run("Set Scale...", "distance=500.5 known=200 pixel=1 unit=µm"); <<warn

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    我試圖改變ImageJ的現有插件OpenComet。我不是Java,所以也許這是一件容易的事。 我試圖實現有以下幾種東西 run("Bio-Formats Windowless Importer", "open=path autoscale color_mode=Default view=Hyperstack stack_order=XYCZT"); 打開與Bioformat進口商插件 run("

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    我寫了一個多語言3-D圖像去噪ImageJ插件,它對圖像執行一些操作並將去噪圖像作爲一維數組返回。一維數組包含NaN值(邊緣附近)。一維數組轉換回圖像堆棧並顯示。它只是黑色。我保存了圖像堆棧並再次在ImageJ中打開它。我將光標移到圖像上,看到值應該改變。在一些地方(我認爲神經元是)像素值在1000-4000的範圍內。然而,整個圖像只是黑色。這裏是一個數組轉換爲圖像堆疊在最後的代碼片段: # Im

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    我需要並排呈現一些顯微鏡圖像,並確保它們在演示文稿中可以直接進行比較。這些照片都是採用相同的曝光,增益等等,所以底層像素值應該是可比較的。 但是,顯微鏡軟件有一個令人討厭的習慣,即保存其中一個顏色通道飽和(出於某種原因)的文件,因此我必須處理這些圖像以進行演示。 以前我一直在使用它通過一個文件夾處理並調用腳本命令 run("Enhance Contrast", "saturated=0.35");

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    我想使用Python 3.4.2控制ImageJ的 我想要做的是從Python代碼,我想送訂單的ImageJ到analayse一些圖像控制ImageJ的,邊緣檢測,對比度,噪音等 這裏有一個類似的問題 How to connect ImageJ to python? 但沒有答案,如「安裝這個,以及與此命令來控制查找邊緣按鈕」 我不知道如何能做到這一點,有人可以幫我 我找到了這個link和link,