imagej

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我知道這已經發布到其他地方，並且這不是一個難題，但我很興奮在FIJI編寫宏，並且很難理解各種在線資源中描述的解決方案我有一系列的圖像都在同一個文件夾，並希望對它們應用相同的操作，並將生成的excel文件和圖像保存在輸出文件夾中。具體來說，我想打開，平滑圖像，進行最大強度Z投影，然後將圖像閾值設置爲相同的相對值。這個閾值是導致問題的一個步驟。通過相對值，我的意思是我想設置閾值，以便包括強度直方圖

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SE MTF奈奎斯特插件的圖像

我想寫一個宏，在斐濟的SE MTF奈奎斯特插件堆棧或目錄中的許多圖像。但是我必須爲設置窗口中的每個圖像設置一些參數。有任何想法嗎？ macro "TD2"{ inputFolder = getDirectory(''); outputFolder = gerDirectory(''); setBatchMode(true); images = getFileList(inputFolde

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多個堆棧的平均數

如何一次平均多個堆棧？理想情況下使用像ImageJ這樣的GUI工具？我想在大約10-20個堆棧上做到這一點：1500x1500像素，500片，每個堆棧中有1個通道。一次加載所有這些將會推動我的RAM的極限。作爲一個輸出，我想要一個堆棧（1500x1500像素，500個切片，1個通道），其強度平均在不同的堆棧上。 ImageJ似乎限於一次平均2個堆棧。我希望所有堆疊的平均重量在最終平均值。

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在ImageJ宏中打開.fit文件

我正在打開一系列.fit文件，並使用宏將它們重新另存爲ImageJ中的Jpegs。我是ImageJ中的代碼編寫的完全新手，所以可能做錯了什麼。我得到上來錯誤消息可以看出，我的代碼一起，在下面的圖片：我仔細檢查過：該文件肯定是在那個位置，我仍然可以打開的ImageJ如果我只是雙擊文件夾中的它。任何想法爲什麼這會出錯？

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ImageJ的宏路徑問題

在宏我寫，我想結果從導出插件採用以下結構： savePath = newfolder+"\\"+fileid; run("Export results", "filepath=savePath fileformat=[CSV (comma separated)]...; 其中的fileid是一種簡單的文件的名稱從數組中拉出（即「cell_1」）。在調試控制檯，savePath讀取「C：\用

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如何更改黑色的白色背景

在最近的項目中，我必須操作圖像，但由於這對我來說是新的，所以我迷失了方向。我需要使用常規掃描設備掃描手。我可以做到這一點，但背景是白色的，我需要它是黑色的。經過幾天的研究找到改變顏色的方式，我只有一個圖像，似乎在ms paint中剪切和粘貼。原始圖像：測試：我需要的是這樣的：我嘗試使用Marvin Framework,Imagej,Catalano框架。要查看我需要的設置，我使用gimp

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使用宏在FIJI上打開一個.im文件（nanoSIMS數據）

我正在尋找一個宏命令來打開FIJI中的.im文件。由於斐濟不支持.IM格式，它需要一個插件叫做OpenMIMS，但簡單的線條： run("Open MIMS Image"); open(" directory "); 將給出錯誤信息：文件不支持格式，閱讀器插件不可用，或者未找到。一個幾乎相同的問題顯然已經被問和解決這裏 - Problems with an ImageJ plugin，

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ImageJ同步窗口

我想知道是否可以在ImageJ中設置從宏中同步Windows的參數。 // This will open the Synchronize Windows Function run("Synchronize Windows"); 我最好的猜測： run("Synchronize Windows", "select=&Image1 Cursor Scaling z-Slices"); 請多關

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在ImageJ中的一個圖中的向量（Java）

我在ImageJ中編寫了一個插件，我需要一些想法。我有一個爲堆棧中的每個圖像生成圖的插件。所以如果我在一個堆棧中有4個圖像，它將從矢量生成4個圖。但我需要用4條曲線繪製一條曲線。請幫幫我。 ` 這是代碼。 public void run(String arg){ openImage(); if (cancel==false){ options();

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ImageJ-如何從圖像堆中的實際處理圖像中獲取slicename

我在ImageJ中從圖像堆棧獲取文件名時出現問題。我寫的，可以在圖像堆棧中使用，並在堆棧中給出的輸出結果爲每個圖像與插件： if (mfpc == true) { IJ.log(fileName+": Good"); } else { IJ.log(fileName+": Bad"); } 的getTitle（）適用於單張圖片，但只顯示堆棧