imagej

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我正在尋找ImageJ和R的集成。有一個名爲RImageJ的軟件包，在[1] [2]中引用了以前版本的R（我正在使用R 3.1.2（2014） -10-31） - 「南瓜頭盔」），但它不再可用。基本上我想嘗試的是在R中的圖像上的區域增長算法。有誰知道更新版本的RImageJ或另一個允許此算法的包？感謝） [1] http://romainfrancois.blog.free.fr/index.

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Python中的ImageJ/FIJI中的自動閾值

我正試圖在ImageJ中編寫python腳本，並且遇到了自動閾值問題。它不會讓我使用IJ.setAutoThreshold("Default dark")。代碼示例位下方（爲了清楚起見，省略了一些東西）： from ij import IJ, ImagePlus from java.lang import Runtime, Runnable import os for i in file

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如何使用imageJ來合併不同的渠道和做az平均

我有十個tiff文件，每個包含兩個通道的成像數據，我想標記兩個通道的不同顏色，然後做az投影，任何人都知道怎麼做？

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作物自定義形狀

我有越來越多的纖維，看起來像下面現在圖像想象，這個光纖將不斷增長和.TIFF視頻文件直線縮小。現在我想以某種方式將包含光纖的視頻區域剪下來，例如黑色背景圖像。現在，當我玩，我想只是看視頻不斷增長的光纖區域與黑色背景其他地方的視頻。問題：有沒有辦法在ImageJ中預製不規則形狀物體的「自定義」作物？如果你不知道ImageJ是否可以做這種圖像處理，歡迎任何其他軟件選項。感謝您的幫助

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什麼是一個很好的方式來加載一個數組中的很多圖片及其引用？ - Java + ImageJ

我有例如1000個圖像和他們的名字都非常相似，他們只是不同的數字。「ImageNmbr0001」，「ImageNmbr0002」，.....，ImageNmbr1000等; 我想獲取每個圖像並將它們存儲到ImageProcessor數組中。所以，例如，如果我在這個數組的元素上使用了一個方法，那麼這個方法被應用在圖片上，例如計算它中的黑色像素。我可以使用for循環獲取從1到1000的數字，將它們

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如何使用Java在ImageJ2中將圖像從8位轉換爲RGB

我試圖直接使用來自Java的ImageJ2來創建來自輸入圖像的二值化圖像。 A的我的代碼有些工作版本是這樣的： final File file = new File("input.png"); try { DefaultDataTypeService dataTypeService = new DefaultDataTypeService(); Dataset datase

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ImageJ JavaScript，我如何循環目錄？

我想創建一個腳本，將循環通過目錄，並打開一個圖像，並分析它等.. 所以我想轉換類似下面的腳本到一個循環; //sets the pixel height and width height = 15; width = 15; //navigates to the folder and opens the image IJ.run("Raw...", "open=[C:\\Users\\

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ImageJ：在製作圖像二進制文件時，如何確保相鄰單元格未連接？（不分水嶺）

我正在嘗試計算具有不規則形狀的單元格。將圖像製作成二進制文件後，一些單元格被連接起來併成爲一個大塊。結果，通過粒子分析，許多相鄰的細胞被計爲一個。在這種情況下分水嶺不起作用，因爲這些單元不具有相似的形狀，並且許多單個單元被分成許多分段。到目前爲止，我的最佳嘗試是在翻轉圖像二進制之前將背景噪音降至最低。但還有另一種方式嗎？謝謝你在前進， KL

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ImageJ：計算面積時使用ROI分析粒子％

我是一名使用ImageJ的初學者。我有一個帶有空洞的4「直徑晶圓的圖像，我第一次縮放圖像，然後做一個閾值顏色，只突出顯示空洞，然後在晶圓周圍放上一個ROI 然後運行Analyze Particles例程中，它很好地包圍了空隙，在彙總表中，Total Area欄似乎出現在Total Void Area的正確＃處，但％Area欄＃很低，我想是因爲它使用Total Area \整個圖像區域，我想告訴我晶

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Matlab和ImageJ檢測骨折

我試圖檢測使用imageJ和Matlab的圖片中的骨折，他們都是必需的。這裏是原始圖像：我已經建立的MATLAB和ImageJ的之間的連接，我已經打開了ImageJ的圖像，並做一些事情開始。首先，我使用imageJ菜單中的查找邊緣功能來獲取骨骼輪廓。在我做了一個增強大綱以增強大綱之後。我現在的問題是，只有一個輪廓和一個黑色的背景，我怎麼才能製作一個算法或類似的東西，這會告訴我，線路不連接？（意